261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0006 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0006  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  100 
 
 
153 aa  308  1e-83  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  42.28 
 
 
166 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  42.95 
 
 
160 aa  138  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  45.64 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0074  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  46.31 
 
 
165 aa  133  8e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  44 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5443  ribose 5-phosphate isomerase  41.72 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2531  ribose 5-phosphate isomerase  42.28 
 
 
155 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1598  ribose-5-phosphate isomerase B  40.82 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.113376  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12490  ribose-5-phosphate isomerase B  42.38 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7320  ribose/galactose isomerase  41.5 
 
 
169 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  40.27 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3408  ribose 5-phosphate isomerase  36.24 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1401  ribose 5-phosphate isomerase  40.94 
 
 
160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3889  ribose-5-phosphate isomerase B  38.41 
 
 
155 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1356  ribose 5-phosphate isomerase  41.61 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  41.33 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.24 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3599  ribose-5-phosphate isomerase B  42.38 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186156  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3672  ribose-5-phosphate isomerase B  42.38 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.615114  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3604  ribose-5-phosphate isomerase B  42.38 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152341  normal  0.756157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2041  ribose 5-phosphate isomerase  41.61 
 
 
157 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3522  ribose-5-phosphate isomerase B  37.58 
 
 
162 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.55 
 
 
146 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11900  ribose 5-phosphate isomerase  38.26 
 
 
157 aa  123  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1105  ribose 5-phosphate isomerase  37.33 
 
 
152 aa  121  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1551  ribose 5-phosphate isomerase  36.67 
 
 
163 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24510  ribose 5-phosphate isomerase  35.33 
 
 
149 aa  120  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.893298  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0947  ribose 5-phosphate isomerase  36.42 
 
 
150 aa  120  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7302  ribose-5-phosphate isomerase B  38.26 
 
 
159 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160581  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  43.54 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3514  ribose-5-phosphate isomerase B  35.76 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1553  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.62 
 
 
147 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  43.45 
 
 
150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2162  ribose-5-phosphate isomerase B  38.56 
 
 
164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000167121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  41.61 
 
 
322 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5303  ribose-5-phosphate isomerase B  37.58 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430947  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.14 
 
 
143 aa  117  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  39.6 
 
 
152 aa  117  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  42.96 
 
 
148 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  42.45 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2408  ribose-5-phosphate isomerase B  39.07 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.683138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.89 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1375  ribose 5-phosphate isomerase  37.41 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2620  ribose 5-phosphate isomerase  36.67 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.285539  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.55 
 
 
144 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.84 
 
 
149 aa  114  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  41.26 
 
 
151 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.76 
 
 
148 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0481  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.26 
 
 
150 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.41 
 
 
152 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  42.96 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  40.82 
 
 
149 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09810  ribose-5-phosphate isomerase B  38.41 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0167583  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  36.42 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2120  ribose-5-phosphate isomerase  39.04 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00298451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.5 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.94 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  39.07 
 
 
149 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  38.1 
 
 
148 aa  110  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0170  ribose-5-phosphate isomerase  39.16 
 
 
148 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  43.36 
 
 
162 aa  110  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  37.75 
 
 
149 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  37.75 
 
 
149 aa  110  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  37.75 
 
 
149 aa  110  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  38.67 
 
 
149 aa  110  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  37.75 
 
 
149 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  40.28 
 
 
143 aa  110  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.82 
 
 
145 aa  110  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09040  ribose 5-phosphate isomerase  37.84 
 
 
153 aa  110  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0154661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  40.28 
 
 
143 aa  110  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  40.82 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  40.82 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  37.33 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.58 
 
 
391 aa  108  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  40.43 
 
 
144 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1446  ribose 5-phosphate isomerase B  38.19 
 
 
144 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.396381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21560  ribose-5-phosphate isomerase  41.55 
 
 
146 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971955  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1171  ribose 5-phosphate isomerase B  37.59 
 
 
148 aa  108  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0563702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2734  ribose 5-phosphate isomerase B  38.67 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.33 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.46 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.44 
 
 
143 aa  107  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2228  ribose 5-phosphate isomerase B  38.19 
 
 
147 aa  107  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000313562  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.43 
 
 
142 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  39.46 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.25 
 
 
144 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  39.33 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.73 
 
 
142 aa  106  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3483  ribose-5-phosphate isomerase B  37.09 
 
 
162 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  39.73 
 
 
148 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.06 
 
 
154 aa  106  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0401  ribose/galactose isomerase  40.56 
 
 
149 aa  105  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0557061  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  37.59 
 
 
149 aa  104  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  35.92 
 
 
150 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  38 
 
 
147 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0217  ribose 5-phosphate isomerase B  37.24 
 
 
152 aa  104  4e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00182493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1034  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.51 
 
 
146 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.257274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  40.41 
 
 
149 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>