270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0809 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  100 
 
 
148 aa  301  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  62.5 
 
 
149 aa  191  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  59.03 
 
 
149 aa  183  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  60.27 
 
 
149 aa  181  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  57.82 
 
 
149 aa  181  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  56.76 
 
 
152 aa  180  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  61.38 
 
 
149 aa  179  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  61.38 
 
 
149 aa  179  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  59.86 
 
 
148 aa  179  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  56.76 
 
 
148 aa  178  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  58.62 
 
 
181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  57.43 
 
 
149 aa  176  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  60.84 
 
 
148 aa  175  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  55.1 
 
 
322 aa  174  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  59.57 
 
 
370 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  57.24 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  56.25 
 
 
149 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  58.62 
 
 
145 aa  169  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  56.34 
 
 
151 aa  167  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  55.63 
 
 
151 aa  167  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  56.16 
 
 
147 aa  167  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  53.52 
 
 
151 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  53.74 
 
 
149 aa  167  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0682  ribose 5-phosphate isomerase B  53.96 
 
 
145 aa  166  8e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  53.79 
 
 
152 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  53.06 
 
 
149 aa  164  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  54.86 
 
 
148 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  52.78 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  52.78 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  52.78 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  52.78 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  54.17 
 
 
153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  52.08 
 
 
149 aa  160  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  55.17 
 
 
145 aa  157  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  49.32 
 
 
153 aa  155  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1606  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  52.78 
 
 
148 aa  154  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  51.03 
 
 
147 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  51.03 
 
 
147 aa  154  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  51.03 
 
 
147 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  51.03 
 
 
147 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  53.15 
 
 
148 aa  155  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  50.34 
 
 
147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  50.34 
 
 
147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  50.34 
 
 
147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  50 
 
 
147 aa  154  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  51.43 
 
 
142 aa  153  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  51.72 
 
 
149 aa  153  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  50.34 
 
 
147 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  50.34 
 
 
147 aa  152  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21560  ribose-5-phosphate isomerase  51.39 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971955  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  49.65 
 
 
162 aa  150  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  52.86 
 
 
146 aa  150  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  49.66 
 
 
147 aa  150  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000611048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  51.75 
 
 
142 aa  150  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.97 
 
 
152 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  51.37 
 
 
152 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  53.15 
 
 
143 aa  149  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.95 
 
 
147 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  46.9 
 
 
152 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  53.15 
 
 
143 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  51.37 
 
 
148 aa  148  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  49.29 
 
 
144 aa  147  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  53.57 
 
 
143 aa  147  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  48.95 
 
 
147 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.23 
 
 
150 aa  147  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2734  ribose 5-phosphate isomerase B  49.31 
 
 
147 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  48.95 
 
 
147 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1747  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  50 
 
 
145 aa  146  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12150  ribose-5-phosphate isomerase  50.69 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  48.61 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  51.02 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  51.02 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50.71 
 
 
142 aa  144  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  47.86 
 
 
148 aa  144  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  51.02 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  51.02 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0889  ribose 5-phosphate isomerase B  49.65 
 
 
145 aa  144  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  51.02 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  51.02 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  51.02 
 
 
164 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1003  ribose 5-phosphate isomerase B  49.65 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  48.63 
 
 
153 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  47.14 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  49.31 
 
 
148 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  48.57 
 
 
144 aa  142  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  46.9 
 
 
157 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0170  ribose-5-phosphate isomerase  47.52 
 
 
148 aa  142  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1042  ribose 5-phosphate isomerase B  50.69 
 
 
148 aa  142  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  46.62 
 
 
152 aa  142  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  46.62 
 
 
152 aa  142  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0932  ribose 5-phosphate isomerase B  48.94 
 
 
145 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  49.65 
 
 
143 aa  141  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.55 
 
 
148 aa  140  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1196  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  54.93 
 
 
156 aa  140  8e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  46.21 
 
 
149 aa  140  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  47.95 
 
 
152 aa  140  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.61 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  47.65 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  45.45 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.65 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.618106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>