260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1598 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1598  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
160 aa  326  8e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.113376  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1356  ribose 5-phosphate isomerase  68.39 
 
 
155 aa  224  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2531  ribose 5-phosphate isomerase  65.81 
 
 
155 aa  216  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3408  ribose 5-phosphate isomerase  60.65 
 
 
155 aa  205  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  59.35 
 
 
166 aa  204  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7302  ribose-5-phosphate isomerase B  58.6 
 
 
159 aa  202  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160581  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7320  ribose/galactose isomerase  58.06 
 
 
169 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  58.71 
 
 
161 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5303  ribose-5-phosphate isomerase B  63.76 
 
 
161 aa  193  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430947  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3889  ribose-5-phosphate isomerase B  59.35 
 
 
155 aa  193  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09810  ribose-5-phosphate isomerase B  59.48 
 
 
157 aa  190  6e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0167583  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1162  ribose-5-phosphate isomerase B  60.65 
 
 
162 aa  190  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0742632  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1551  ribose 5-phosphate isomerase  60.96 
 
 
163 aa  188  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3483  ribose-5-phosphate isomerase B  57.23 
 
 
162 aa  187  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11900  ribose 5-phosphate isomerase  57.42 
 
 
157 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3514  ribose-5-phosphate isomerase B  55.48 
 
 
155 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12490  ribose-5-phosphate isomerase B  56.13 
 
 
162 aa  184  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2041  ribose 5-phosphate isomerase  57.42 
 
 
157 aa  184  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  54.84 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  55.48 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1401  ribose 5-phosphate isomerase  55.48 
 
 
160 aa  180  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5443  ribose 5-phosphate isomerase  58.71 
 
 
159 aa  180  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0947  ribose 5-phosphate isomerase  57.43 
 
 
150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3522  ribose-5-phosphate isomerase B  58.06 
 
 
162 aa  178  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  56.38 
 
 
160 aa  177  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2408  ribose-5-phosphate isomerase B  53.95 
 
 
164 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.683138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2162  ribose-5-phosphate isomerase B  53.29 
 
 
164 aa  174  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000167121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24510  ribose 5-phosphate isomerase  56.08 
 
 
149 aa  173  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.893298  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1375  ribose 5-phosphate isomerase  56.08 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2620  ribose 5-phosphate isomerase  55.48 
 
 
149 aa  168  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.285539  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3599  ribose-5-phosphate isomerase B  56.13 
 
 
162 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186156  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3672  ribose-5-phosphate isomerase B  56.13 
 
 
162 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.615114  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3604  ribose-5-phosphate isomerase B  56.13 
 
 
162 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152341  normal  0.756157 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1105  ribose 5-phosphate isomerase  53.06 
 
 
152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79146  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09040  ribose 5-phosphate isomerase  53.29 
 
 
153 aa  163  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0154661 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0006  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.82 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.14 
 
 
143 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  47.86 
 
 
142 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0074  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  41.61 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  43.15 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1196  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.22 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0401  ribose/galactose isomerase  45.65 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0557061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.85 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  38.78 
 
 
146 aa  108  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  40.27 
 
 
148 aa  108  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0217  ribose 5-phosphate isomerase B  38.89 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00182493  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  37.93 
 
 
143 aa  107  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  36.24 
 
 
152 aa  107  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  36.24 
 
 
152 aa  107  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2621  ribose/galactose isomerase  40.27 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  35.57 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  39.72 
 
 
145 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  42.55 
 
 
149 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0889  ribose 5-phosphate isomerase B  43.97 
 
 
145 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.36 
 
 
143 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.75 
 
 
144 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.84 
 
 
148 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  40 
 
 
149 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1003  ribose 5-phosphate isomerase B  42.55 
 
 
145 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  40.56 
 
 
162 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0932  ribose 5-phosphate isomerase B  43.26 
 
 
145 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  39.73 
 
 
149 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  35.62 
 
 
154 aa  103  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.27 
 
 
153 aa  103  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  43.06 
 
 
148 aa  103  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  41.5 
 
 
149 aa  103  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.38 
 
 
153 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  41.67 
 
 
143 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.1 
 
 
147 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  41.26 
 
 
145 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.27 
 
 
149 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  41.67 
 
 
143 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.72 
 
 
391 aa  102  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  41.96 
 
 
150 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.47 
 
 
147 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.15 
 
 
147 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0682  ribose 5-phosphate isomerase B  42.25 
 
 
145 aa  102  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4198  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.14 
 
 
145 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335941  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.04 
 
 
150 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1042  ribose 5-phosphate isomerase B  37.93 
 
 
148 aa  101  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.41 
 
 
149 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.18 
 
 
149 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.36 
 
 
152 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0638  ribose 5-phosphate isomerase B  41.67 
 
 
148 aa  100  7e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0815876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.04 
 
 
145 aa  100  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21560  ribose-5-phosphate isomerase  41.61 
 
 
146 aa  100  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971955  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2228  ribose 5-phosphate isomerase B  43.97 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000313562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  41.38 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  41.78 
 
 
147 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.16 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.66 
 
 
142 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_002950  PG1747  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  43.48 
 
 
145 aa  99  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  37.76 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
150 aa  99  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  38.36 
 
 
148 aa  99  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0934  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.73 
 
 
161 aa  99  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.759422  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1034  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.22 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.257274 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.69 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  41.5 
 
 
148 aa  97.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>