254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2408 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2408  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
164 aa  334  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.683138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2162  ribose-5-phosphate isomerase B  90.8 
 
 
164 aa  304  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000167121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09810  ribose-5-phosphate isomerase B  81.94 
 
 
157 aa  259  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0167583  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24510  ribose 5-phosphate isomerase  70.47 
 
 
149 aa  213  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.893298  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1105  ribose 5-phosphate isomerase  65.1 
 
 
152 aa  204  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3514  ribose-5-phosphate isomerase B  63.64 
 
 
155 aa  204  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2620  ribose 5-phosphate isomerase  66.67 
 
 
149 aa  201  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.285539  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3483  ribose-5-phosphate isomerase B  63.46 
 
 
162 aa  200  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3889  ribose-5-phosphate isomerase B  61.69 
 
 
155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0947  ribose 5-phosphate isomerase  62.91 
 
 
150 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  61.54 
 
 
161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1375  ribose 5-phosphate isomerase  65.1 
 
 
150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11900  ribose 5-phosphate isomerase  61.84 
 
 
157 aa  195  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3408  ribose 5-phosphate isomerase  58.44 
 
 
155 aa  188  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3522  ribose-5-phosphate isomerase B  60.39 
 
 
162 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1401  ribose 5-phosphate isomerase  60.53 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  58.44 
 
 
166 aa  187  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  61.84 
 
 
160 aa  187  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1356  ribose 5-phosphate isomerase  57.79 
 
 
155 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2531  ribose 5-phosphate isomerase  58.44 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5443  ribose 5-phosphate isomerase  59.74 
 
 
159 aa  181  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1551  ribose 5-phosphate isomerase  59.06 
 
 
163 aa  176  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1598  ribose-5-phosphate isomerase B  53.95 
 
 
160 aa  175  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.113376  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5303  ribose-5-phosphate isomerase B  57.14 
 
 
161 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430947  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7320  ribose/galactose isomerase  55.84 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2041  ribose 5-phosphate isomerase  55.56 
 
 
157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  58.28 
 
 
157 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  56.95 
 
 
157 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12490  ribose-5-phosphate isomerase B  54.9 
 
 
162 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7302  ribose-5-phosphate isomerase B  53.25 
 
 
159 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160581  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09040  ribose 5-phosphate isomerase  55.56 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0154661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1162  ribose-5-phosphate isomerase B  53.9 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0742632  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3599  ribose-5-phosphate isomerase B  55.56 
 
 
162 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186156  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3672  ribose-5-phosphate isomerase B  55.56 
 
 
162 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.615114  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3604  ribose-5-phosphate isomerase B  55.56 
 
 
162 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152341  normal  0.756157 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0217  ribose 5-phosphate isomerase B  45.52 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0006  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.07 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  43.05 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  43.05 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1196  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.99 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0934  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.759422  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.07 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  45.58 
 
 
142 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  42.28 
 
 
154 aa  107  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1034  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.39 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.257274 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  39.07 
 
 
152 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0401  ribose/galactose isomerase  41.5 
 
 
149 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0557061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.31 
 
 
147 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  40.67 
 
 
146 aa  106  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.14 
 
 
146 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4198  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.83 
 
 
145 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335941  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0074  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  38.67 
 
 
165 aa  102  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  38.78 
 
 
143 aa  102  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0638  ribose 5-phosphate isomerase B  38.78 
 
 
148 aa  101  4e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0815876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.5 
 
 
143 aa  101  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  39.33 
 
 
149 aa  101  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.82 
 
 
152 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2621  ribose/galactose isomerase  39.22 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  41.5 
 
 
145 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  38.78 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 
370 aa  99.4  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.62 
 
 
391 aa  99  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.33 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1003  ribose 5-phosphate isomerase B  40 
 
 
145 aa  98.2  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38 
 
 
149 aa  98.2  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  40.27 
 
 
322 aa  98.2  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.89 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  42 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0932  ribose 5-phosphate isomerase B  41.38 
 
 
145 aa  97.8  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  38.36 
 
 
151 aa  97.4  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.93 
 
 
145 aa  97.4  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  42.67 
 
 
147 aa  97.1  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38 
 
 
149 aa  97.1  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.618106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.67 
 
 
148 aa  97.1  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21560  ribose-5-phosphate isomerase  40.94 
 
 
146 aa  97.1  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971955  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  38.67 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  38.62 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  38.62 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0889  ribose 5-phosphate isomerase B  40.69 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  42.67 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.41 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2809  ribose-5-phosphate isomerase B  35.76 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119147  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  38.62 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1446  ribose 5-phosphate isomerase B  41.84 
 
 
144 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.396381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  38.67 
 
 
149 aa  95.5  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1117  ribose-5-phosphate isomerase B  37.33 
 
 
150 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  39.19 
 
 
149 aa  94.7  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.94 
 
 
149 aa  94.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0682  ribose 5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
145 aa  94.7  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  36.84 
 
 
148 aa  94.4  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.47 
 
 
149 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.24 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  38.62 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.6 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  38.93 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  36.67 
 
 
149 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  41.1 
 
 
145 aa  92  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.1 
 
 
150 aa  91.7  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  34.67 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>