262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11660 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
160 aa  327  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24510  ribose 5-phosphate isomerase  72.3 
 
 
149 aa  225  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.893298  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1105  ribose 5-phosphate isomerase  69.86 
 
 
152 aa  218  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79146  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1375  ribose 5-phosphate isomerase  69.18 
 
 
150 aa  210  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0947  ribose 5-phosphate isomerase  64.19 
 
 
150 aa  204  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2620  ribose 5-phosphate isomerase  66.44 
 
 
149 aa  203  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.285539  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1551  ribose 5-phosphate isomerase  68.71 
 
 
163 aa  203  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2531  ribose 5-phosphate isomerase  65.1 
 
 
155 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  61.07 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1401  ribose 5-phosphate isomerase  62.42 
 
 
160 aa  197  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3522  ribose-5-phosphate isomerase B  63.09 
 
 
162 aa  197  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3408  ribose 5-phosphate isomerase  61.74 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5443  ribose 5-phosphate isomerase  63.51 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2041  ribose 5-phosphate isomerase  61.07 
 
 
157 aa  194  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5303  ribose-5-phosphate isomerase B  65.1 
 
 
161 aa  193  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430947  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3889  ribose-5-phosphate isomerase B  62.16 
 
 
155 aa  192  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7320  ribose/galactose isomerase  61.07 
 
 
169 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  61.74 
 
 
161 aa  191  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09810  ribose-5-phosphate isomerase B  64.71 
 
 
157 aa  191  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0167583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7302  ribose-5-phosphate isomerase B  58.39 
 
 
159 aa  191  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160581  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2162  ribose-5-phosphate isomerase B  63.16 
 
 
164 aa  190  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000167121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1356  ribose 5-phosphate isomerase  59.73 
 
 
155 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3514  ribose-5-phosphate isomerase B  62.16 
 
 
155 aa  188  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2408  ribose-5-phosphate isomerase B  61.84 
 
 
164 aa  187  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.683138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  57.43 
 
 
157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12490  ribose-5-phosphate isomerase B  56.76 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11900  ribose 5-phosphate isomerase  59.06 
 
 
157 aa  181  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3483  ribose-5-phosphate isomerase B  60.78 
 
 
162 aa  181  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  56.76 
 
 
157 aa  180  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1162  ribose-5-phosphate isomerase B  56.17 
 
 
162 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0742632  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09040  ribose 5-phosphate isomerase  58.17 
 
 
153 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0154661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1598  ribose-5-phosphate isomerase B  56.38 
 
 
160 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.113376  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3599  ribose-5-phosphate isomerase B  59.46 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186156  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3672  ribose-5-phosphate isomerase B  59.46 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.615114  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3604  ribose-5-phosphate isomerase B  59.46 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152341  normal  0.756157 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0006  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.95 
 
 
153 aa  138  3e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  49.64 
 
 
143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_002950  PG1747  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  45.07 
 
 
145 aa  121  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.9 
 
 
149 aa  120  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4198  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.91 
 
 
145 aa  120  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335941  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1196  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.33 
 
 
156 aa  117  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  40.97 
 
 
143 aa  117  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.17 
 
 
153 aa  117  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  44.6 
 
 
142 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  45.32 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.82 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5648  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.95 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609634  normal  0.681058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.96 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  45.65 
 
 
150 aa  115  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.85 
 
 
146 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.14 
 
 
152 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  42.28 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  42.28 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  41.55 
 
 
148 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.52 
 
 
148 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  42.25 
 
 
150 aa  114  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0074  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  43.45 
 
 
165 aa  114  6e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  40.85 
 
 
151 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2621  ribose/galactose isomerase  40.27 
 
 
150 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.21 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  41.01 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  40.82 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  41.01 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  42.86 
 
 
154 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3821  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.57 
 
 
146 aa  111  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0187638  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
150 aa  111  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  45.21 
 
 
147 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.55 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  42.47 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  42.47 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.67 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1446  ribose 5-phosphate isomerase B  44.37 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.396381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  38.93 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  41.55 
 
 
145 aa  110  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.76 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  40.14 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  43.84 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.55 
 
 
143 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.6 
 
 
149 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  38.93 
 
 
148 aa  108  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0217  ribose 5-phosphate isomerase B  38.73 
 
 
152 aa  108  3e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.14 
 
 
142 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  40.41 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.78 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0170  ribose-5-phosphate isomerase  41.96 
 
 
148 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0481  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.93 
 
 
150 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  40.82 
 
 
152 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.17 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0401  ribose/galactose isomerase  40.58 
 
 
149 aa  106  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0557061  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
370 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.57 
 
 
150 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.41 
 
 
145 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  42.75 
 
 
149 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0934  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.41 
 
 
161 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.759422  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.03 
 
 
144 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  38.46 
 
 
162 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1026  ribose 5-phosphate isomerase B  45.07 
 
 
148 aa  104  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  38.1 
 
 
322 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1553  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  44.06 
 
 
147 aa  104  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.04 
 
 
149 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>