261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1145 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
161 aa  329  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1401  ribose 5-phosphate isomerase  78.71 
 
 
160 aa  257  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2041  ribose 5-phosphate isomerase  76.13 
 
 
157 aa  247  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11900  ribose 5-phosphate isomerase  76.13 
 
 
157 aa  242  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12490  ribose-5-phosphate isomerase B  69.62 
 
 
162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  72.26 
 
 
157 aa  234  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  70.97 
 
 
157 aa  233  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3514  ribose-5-phosphate isomerase B  67.1 
 
 
155 aa  228  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3889  ribose-5-phosphate isomerase B  66.45 
 
 
155 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5443  ribose 5-phosphate isomerase  68.15 
 
 
159 aa  223  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3599  ribose-5-phosphate isomerase B  71.61 
 
 
162 aa  220  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186156  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3672  ribose-5-phosphate isomerase B  71.61 
 
 
162 aa  220  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.615114  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3604  ribose-5-phosphate isomerase B  71.61 
 
 
162 aa  220  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152341  normal  0.756157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3522  ribose-5-phosphate isomerase B  66.45 
 
 
162 aa  218  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  63.87 
 
 
166 aa  217  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3408  ribose 5-phosphate isomerase  63.87 
 
 
155 aa  216  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7320  ribose/galactose isomerase  65.81 
 
 
169 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1105  ribose 5-phosphate isomerase  67.12 
 
 
152 aa  207  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2531  ribose 5-phosphate isomerase  65.16 
 
 
155 aa  206  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24510  ribose 5-phosphate isomerase  67.12 
 
 
149 aa  205  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.893298  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1356  ribose 5-phosphate isomerase  61.94 
 
 
155 aa  204  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7302  ribose-5-phosphate isomerase B  60 
 
 
159 aa  204  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160581  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1551  ribose 5-phosphate isomerase  62.09 
 
 
163 aa  201  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2162  ribose-5-phosphate isomerase B  62.09 
 
 
164 aa  198  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000167121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09810  ribose-5-phosphate isomerase B  62.34 
 
 
157 aa  197  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0167583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2408  ribose-5-phosphate isomerase B  61.54 
 
 
164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.683138  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1598  ribose-5-phosphate isomerase B  58.71 
 
 
160 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.113376  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  61.74 
 
 
160 aa  191  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0947  ribose 5-phosphate isomerase  61.49 
 
 
150 aa  190  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3483  ribose-5-phosphate isomerase B  61.01 
 
 
162 aa  187  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1375  ribose 5-phosphate isomerase  61.64 
 
 
150 aa  186  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1162  ribose-5-phosphate isomerase B  56.77 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0742632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5303  ribose-5-phosphate isomerase B  60 
 
 
161 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430947  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09040  ribose 5-phosphate isomerase  58 
 
 
153 aa  176  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0154661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2620  ribose 5-phosphate isomerase  58.22 
 
 
149 aa  175  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.285539  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0006  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.27 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.48 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  38.16 
 
 
152 aa  122  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  38.16 
 
 
152 aa  122  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  48.2 
 
 
142 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1196  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.33 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  36.67 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  36.18 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.26 
 
 
147 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0074  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  44.52 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.44 
 
 
143 aa  117  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  41.5 
 
 
146 aa  114  5e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.54 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.22 
 
 
149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1042  ribose 5-phosphate isomerase B  39.31 
 
 
148 aa  112  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0934  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.1 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.759422  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4198  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.52 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335941  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.86 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0217  ribose 5-phosphate isomerase B  40.69 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  41.26 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.46 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  39.19 
 
 
322 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.38 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.26 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  38.93 
 
 
148 aa  108  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0932  ribose 5-phosphate isomerase B  43.48 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17917  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 
370 aa  107  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.14 
 
 
146 aa  107  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  40.14 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1130  ribose-5-phosphate isomerase  43.26 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.47 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  41.5 
 
 
145 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.58 
 
 
150 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.47 
 
 
148 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.29 
 
 
140 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1003  ribose 5-phosphate isomerase B  42.03 
 
 
145 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0401  ribose/galactose isomerase  42.03 
 
 
149 aa  104  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0557061  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  40.28 
 
 
145 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  39.31 
 
 
149 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0889  ribose 5-phosphate isomerase B  43.48 
 
 
145 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 
151 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  39.04 
 
 
149 aa  104  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.06 
 
 
151 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.38 
 
 
151 aa  104  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  41.78 
 
 
149 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  41.78 
 
 
149 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1171  ribose 5-phosphate isomerase B  37.93 
 
 
148 aa  103  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0563702  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1553  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.26 
 
 
147 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.07 
 
 
149 aa  103  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.59 
 
 
391 aa  103  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  38.85 
 
 
145 aa  103  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.01 
 
 
142 aa  103  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  37.06 
 
 
162 aa  103  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.18 
 
 
147 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  38.36 
 
 
148 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2621  ribose/galactose isomerase  38 
 
 
150 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.97 
 
 
148 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  38.1 
 
 
149 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  39.19 
 
 
150 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  40.56 
 
 
143 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  40.56 
 
 
143 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  39.13 
 
 
150 aa  101  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.43 
 
 
142 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  38.46 
 
 
143 aa  101  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>