261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09040  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
153 aa  308  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0154661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  60.67 
 
 
166 aa  191  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1356  ribose 5-phosphate isomerase  61.18 
 
 
155 aa  191  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2531  ribose 5-phosphate isomerase  60.53 
 
 
155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5443  ribose 5-phosphate isomerase  63.16 
 
 
159 aa  187  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3408  ribose 5-phosphate isomerase  59.87 
 
 
155 aa  187  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7320  ribose/galactose isomerase  58 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  58.17 
 
 
160 aa  179  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7302  ribose-5-phosphate isomerase B  57.24 
 
 
159 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160581  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1162  ribose-5-phosphate isomerase B  59.21 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0742632  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  58 
 
 
161 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5303  ribose-5-phosphate isomerase B  59.6 
 
 
161 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430947  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3522  ribose-5-phosphate isomerase B  57.89 
 
 
162 aa  174  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1105  ribose 5-phosphate isomerase  56.85 
 
 
152 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3483  ribose-5-phosphate isomerase B  57.05 
 
 
162 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2162  ribose-5-phosphate isomerase B  55.56 
 
 
164 aa  167  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000167121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3889  ribose-5-phosphate isomerase B  55.92 
 
 
155 aa  166  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24510  ribose 5-phosphate isomerase  56.85 
 
 
149 aa  166  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.893298  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  53.29 
 
 
157 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11900  ribose 5-phosphate isomerase  55.92 
 
 
157 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1551  ribose 5-phosphate isomerase  55.92 
 
 
163 aa  165  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1401  ribose 5-phosphate isomerase  55.26 
 
 
160 aa  164  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09810  ribose-5-phosphate isomerase B  56.77 
 
 
157 aa  164  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0167583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2408  ribose-5-phosphate isomerase B  55.56 
 
 
164 aa  164  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.683138  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1598  ribose-5-phosphate isomerase B  53.29 
 
 
160 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.113376  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1375  ribose 5-phosphate isomerase  56.16 
 
 
150 aa  161  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3514  ribose-5-phosphate isomerase B  53.95 
 
 
155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12490  ribose-5-phosphate isomerase B  51.32 
 
 
162 aa  160  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0947  ribose 5-phosphate isomerase  54.11 
 
 
150 aa  159  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2041  ribose 5-phosphate isomerase  52.63 
 
 
157 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2620  ribose 5-phosphate isomerase  56.16 
 
 
149 aa  154  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.285539  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  50.66 
 
 
157 aa  154  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3599  ribose-5-phosphate isomerase B  51.32 
 
 
162 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186156  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3672  ribose-5-phosphate isomerase B  51.32 
 
 
162 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.615114  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3604  ribose-5-phosphate isomerase B  51.32 
 
 
162 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152341  normal  0.756157 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  48.61 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.25 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.55 
 
 
142 aa  130  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  44.76 
 
 
148 aa  130  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.15 
 
 
142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.06 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.76 
 
 
144 aa  124  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.62 
 
 
152 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21560  ribose-5-phosphate isomerase  45.89 
 
 
146 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971955  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4198  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.95 
 
 
145 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335941  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  46.76 
 
 
143 aa  120  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  44.29 
 
 
145 aa  120  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  49.3 
 
 
143 aa  120  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  41.96 
 
 
144 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  44.76 
 
 
150 aa  117  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 
152 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 
152 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4874  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.48 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1034  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.57 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.257274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.36 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1196  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.28 
 
 
156 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  38.1 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  39.04 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.61 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  42.36 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.96 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.98 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_002950  PG1747  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  45.93 
 
 
145 aa  111  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  46.76 
 
 
150 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0006  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.84 
 
 
153 aa  110  9e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  40.82 
 
 
149 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12150  ribose-5-phosphate isomerase  41.55 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.07 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.66 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.57 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  39.04 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  40.41 
 
 
145 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  39.31 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3821  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.53 
 
 
146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0187638  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.33 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2621  ribose/galactose isomerase  40.94 
 
 
150 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0074  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  40.28 
 
 
165 aa  105  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  36.49 
 
 
149 aa  105  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.5 
 
 
149 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.21 
 
 
152 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  46.04 
 
 
145 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  40.82 
 
 
322 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  39.73 
 
 
148 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.96 
 
 
391 aa  103  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1057  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.27 
 
 
148 aa  103  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0654915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.41 
 
 
149 aa  103  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 
370 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  38.19 
 
 
150 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.74 
 
 
149 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  40.41 
 
 
149 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0934  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.67 
 
 
161 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.759422  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0401  ribose/galactose isomerase  38.3 
 
 
149 aa  101  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0557061  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  37.67 
 
 
145 aa  100  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0638  ribose 5-phosphate isomerase B  37.59 
 
 
148 aa  100  5e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0815876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0170  ribose-5-phosphate isomerase  40.27 
 
 
148 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  34.9 
 
 
148 aa  100  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  40.69 
 
 
149 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  40.69 
 
 
149 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  38.46 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  40.41 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>