261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7302 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7302  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
159 aa  330  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160581  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3408  ribose 5-phosphate isomerase  67.74 
 
 
155 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7320  ribose/galactose isomerase  66.45 
 
 
169 aa  231  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  67.1 
 
 
166 aa  230  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2531  ribose 5-phosphate isomerase  68.39 
 
 
155 aa  228  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1356  ribose 5-phosphate isomerase  67.74 
 
 
155 aa  227  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  60 
 
 
161 aa  204  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2041  ribose 5-phosphate isomerase  58.6 
 
 
157 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1598  ribose-5-phosphate isomerase B  58.6 
 
 
160 aa  202  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.113376  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3889  ribose-5-phosphate isomerase B  60 
 
 
155 aa  200  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3514  ribose-5-phosphate isomerase B  58.71 
 
 
155 aa  200  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1401  ribose 5-phosphate isomerase  58.6 
 
 
160 aa  199  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5443  ribose 5-phosphate isomerase  59.09 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5303  ribose-5-phosphate isomerase B  62.91 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430947  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1162  ribose-5-phosphate isomerase B  59.12 
 
 
162 aa  197  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0742632  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3522  ribose-5-phosphate isomerase B  60 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12490  ribose-5-phosphate isomerase B  57.05 
 
 
162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11900  ribose 5-phosphate isomerase  59.87 
 
 
157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  58.33 
 
 
157 aa  192  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  58.39 
 
 
160 aa  191  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1551  ribose 5-phosphate isomerase  57.24 
 
 
163 aa  187  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3599  ribose-5-phosphate isomerase B  57.32 
 
 
162 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186156  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3672  ribose-5-phosphate isomerase B  57.32 
 
 
162 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.615114  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3604  ribose-5-phosphate isomerase B  57.32 
 
 
162 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152341  normal  0.756157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24510  ribose 5-phosphate isomerase  57.43 
 
 
149 aa  185  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.893298  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3483  ribose-5-phosphate isomerase B  58.49 
 
 
162 aa  184  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1105  ribose 5-phosphate isomerase  58.22 
 
 
152 aa  183  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  54.14 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0947  ribose 5-phosphate isomerase  57.43 
 
 
150 aa  180  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09040  ribose 5-phosphate isomerase  57.24 
 
 
153 aa  179  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0154661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09810  ribose-5-phosphate isomerase B  56.13 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0167583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1375  ribose 5-phosphate isomerase  55.48 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2162  ribose-5-phosphate isomerase B  53.25 
 
 
164 aa  168  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000167121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2620  ribose 5-phosphate isomerase  54.79 
 
 
149 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.285539  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2408  ribose-5-phosphate isomerase B  53.25 
 
 
164 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.683138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.59 
 
 
143 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  48.2 
 
 
142 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0006  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.26 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.7 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4198  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.26 
 
 
145 aa  114  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335941  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  38.26 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  38.26 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  38.26 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  40.94 
 
 
148 aa  112  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.74 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.86 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2228  ribose 5-phosphate isomerase B  43.17 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000313562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.82 
 
 
149 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.9 
 
 
147 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.45 
 
 
142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2120  ribose-5-phosphate isomerase  42.55 
 
 
146 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00298451  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0074  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  37.93 
 
 
165 aa  107  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  42.34 
 
 
145 aa  107  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  39.57 
 
 
143 aa  107  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  36.73 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2734  ribose 5-phosphate isomerase B  42.47 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3821  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.56 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0187638  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.45 
 
 
144 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1196  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.44 
 
 
156 aa  106  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  40.29 
 
 
148 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1553  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.55 
 
 
147 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  42.03 
 
 
149 aa  105  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.78 
 
 
147 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0217  ribose 5-phosphate isomerase B  38.73 
 
 
152 aa  104  4e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.14 
 
 
146 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.17 
 
 
143 aa  104  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.36 
 
 
147 aa  104  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  38.1 
 
 
322 aa  103  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  41.1 
 
 
147 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2621  ribose/galactose isomerase  36.67 
 
 
150 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  41.78 
 
 
147 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 
370 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.73 
 
 
144 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5648  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.73 
 
 
160 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609634  normal  0.681058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.61 
 
 
143 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.62 
 
 
391 aa  101  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2692  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.18 
 
 
157 aa  100  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0651624  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0932  ribose 5-phosphate isomerase B  42.45 
 
 
145 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17917  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  36.05 
 
 
145 aa  100  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1747  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  40.88 
 
 
145 aa  100  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  40.67 
 
 
150 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  39.57 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.01 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1003  ribose 5-phosphate isomerase B  41.73 
 
 
145 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.69 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  38.85 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2809  ribose-5-phosphate isomerase B  38.41 
 
 
149 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119147  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1034  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.67 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.257274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0934  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  37.41 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.759422  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.73 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.26 
 
 
149 aa  99  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0481  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.61 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576444 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  35.62 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1057  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.89 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0654915  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.51 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  38.57 
 
 
150 aa  97.4  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.03 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  38.85 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0638  ribose 5-phosphate isomerase B  40.58 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0815876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  37.41 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>