112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1516 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1516  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1745  hypothetical protein  52.15 
 
 
218 aa  160  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0889269  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  49.66 
 
 
280 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  49.32 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3639  hypothetical protein  50.34 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  45.52 
 
 
268 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  45.51 
 
 
270 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  46.58 
 
 
271 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  42.67 
 
 
277 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  48.32 
 
 
288 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  46.85 
 
 
263 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  44.97 
 
 
215 aa  120  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  42.76 
 
 
293 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  46.98 
 
 
268 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  40.13 
 
 
279 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  40.27 
 
 
288 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  43.05 
 
 
290 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  43.36 
 
 
275 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  41.38 
 
 
266 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  41.36 
 
 
268 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  42.66 
 
 
262 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  41.61 
 
 
272 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  43.33 
 
 
214 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  41.25 
 
 
265 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  39.52 
 
 
268 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  46.94 
 
 
279 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  44.06 
 
 
270 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  44 
 
 
273 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0403  hypothetical protein  42.38 
 
 
148 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  42.18 
 
 
267 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  42.18 
 
 
279 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  39.35 
 
 
266 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  37.93 
 
 
268 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  37.84 
 
 
306 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  39.1 
 
 
266 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  41.26 
 
 
271 aa  101  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  39.16 
 
 
266 aa  101  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  38.51 
 
 
262 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  57.14 
 
 
252 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  38.62 
 
 
284 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  39.86 
 
 
267 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  38.1 
 
 
272 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  38.75 
 
 
274 aa  99  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  60.71 
 
 
182 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  43.62 
 
 
279 aa  97.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  38.16 
 
 
269 aa  97.4  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  37.33 
 
 
266 aa  97.4  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  38.67 
 
 
267 aa  97.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  39.46 
 
 
277 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  40.52 
 
 
302 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  35.17 
 
 
267 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  36.81 
 
 
264 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  34.91 
 
 
274 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  38.85 
 
 
267 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  32.91 
 
 
333 aa  94.4  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  37.58 
 
 
271 aa  94  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  39.31 
 
 
280 aa  94  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  39.31 
 
 
281 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4030  hypothetical protein  42.57 
 
 
173 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  37.42 
 
 
283 aa  91.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  33.77 
 
 
276 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  39.29 
 
 
268 aa  91.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  37.67 
 
 
234 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  39.86 
 
 
278 aa  90.5  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  36.05 
 
 
283 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  38.36 
 
 
272 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  34.66 
 
 
273 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  35.76 
 
 
277 aa  88.2  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  36.42 
 
 
253 aa  87.8  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  37.41 
 
 
265 aa  87.8  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  37.18 
 
 
266 aa  87.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  30.25 
 
 
266 aa  87.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  33.11 
 
 
269 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  37.24 
 
 
276 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  36.24 
 
 
269 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  34.81 
 
 
271 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  37.67 
 
 
277 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  36.13 
 
 
283 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  34.21 
 
 
270 aa  84  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  35.37 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  33.76 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  36.11 
 
 
277 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  35.62 
 
 
263 aa  81.3  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  34.93 
 
 
272 aa  79  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  36.99 
 
 
323 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  32.88 
 
 
271 aa  77.4  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  33.09 
 
 
278 aa  77.4  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  37.33 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3527  hypothetical protein  47.5 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672122  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  34.01 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  32.64 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  32.89 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  35.09 
 
 
283 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  34.93 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  30.56 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3109  hypothetical protein  37.61 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  31.36 
 
 
271 aa  70.5  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  30.56 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  32.48 
 
 
282 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>