126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0266 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  85.45 
 
 
277 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  58.08 
 
 
273 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  55.81 
 
 
280 aa  292  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  48.58 
 
 
290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  57.21 
 
 
252 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  52.33 
 
 
306 aa  258  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  49.06 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  52.92 
 
 
288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  51.37 
 
 
279 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  48.08 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  47.69 
 
 
302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  43.17 
 
 
271 aa  238  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  46.39 
 
 
293 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  58.56 
 
 
182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  45.42 
 
 
268 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  47.13 
 
 
268 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  42.75 
 
 
275 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  44.49 
 
 
266 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  44.83 
 
 
274 aa  224  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  44.53 
 
 
268 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  45.7 
 
 
268 aa  222  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  45 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  42.08 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  44.32 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  44.84 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  44.49 
 
 
333 aa  219  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  40.88 
 
 
268 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  42.86 
 
 
270 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  42.47 
 
 
279 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  47.79 
 
 
283 aa  215  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  43.4 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  43.73 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  42.97 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  42.86 
 
 
271 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  41.15 
 
 
265 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  47.01 
 
 
266 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  41.98 
 
 
281 aa  208  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  45.63 
 
 
283 aa  208  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  43.08 
 
 
268 aa  208  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  42.07 
 
 
270 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  44.35 
 
 
266 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  41.26 
 
 
273 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  40.38 
 
 
265 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  42.97 
 
 
266 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  41.39 
 
 
272 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  42.39 
 
 
280 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  48.42 
 
 
215 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  42.59 
 
 
253 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  44.44 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  42.59 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  45.38 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  40 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  39.23 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  42.69 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  40.5 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  42.74 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  39.08 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  45.27 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  44.96 
 
 
277 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  42.52 
 
 
269 aa  195  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  42.06 
 
 
276 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  41.37 
 
 
283 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  42.37 
 
 
271 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  40.96 
 
 
267 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  42.08 
 
 
269 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  40.67 
 
 
267 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  40.31 
 
 
277 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  40.15 
 
 
266 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  37.45 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  41.45 
 
 
269 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  39.48 
 
 
267 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  43.36 
 
 
278 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  39.58 
 
 
286 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  40.91 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  42.11 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  40.52 
 
 
271 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  40.34 
 
 
328 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  39.54 
 
 
234 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  41.13 
 
 
273 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  40.23 
 
 
275 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  37.68 
 
 
280 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  39.18 
 
 
283 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  40.89 
 
 
284 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  38.78 
 
 
323 aa  175  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  37.64 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  38.17 
 
 
274 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  38.29 
 
 
276 aa  171  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  39.05 
 
 
278 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  41 
 
 
284 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  35.27 
 
 
277 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  38.35 
 
 
282 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  38.31 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  41.57 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  39.2 
 
 
277 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  36.94 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  33.83 
 
 
278 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  36.33 
 
 
274 aa  158  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  47.46 
 
 
214 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3639  hypothetical protein  47.53 
 
 
169 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.873986 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>