112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3109 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3109  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  331  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  51.85 
 
 
280 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  57.76 
 
 
288 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3639  hypothetical protein  58.04 
 
 
169 aa  134  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  57.27 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  59.46 
 
 
290 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  55.17 
 
 
215 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  47.41 
 
 
306 aa  103  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  49.56 
 
 
279 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  46.09 
 
 
277 aa  98.6  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  48.21 
 
 
279 aa  97.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  46.88 
 
 
252 aa  97.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  46.96 
 
 
279 aa  97.4  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  39.63 
 
 
268 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  41.67 
 
 
288 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  46.55 
 
 
266 aa  95.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  45.95 
 
 
264 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4030  hypothetical protein  44.35 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  43.48 
 
 
302 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0403  hypothetical protein  44.23 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  45.38 
 
 
265 aa  85.1  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  43.59 
 
 
268 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  37.31 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  43.3 
 
 
277 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  37.06 
 
 
275 aa  81.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  43.12 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  45.35 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  46.67 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  44.09 
 
 
268 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  37.88 
 
 
262 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  42.24 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  41.88 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  39.82 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  38.14 
 
 
277 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  37.72 
 
 
273 aa  74.7  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1516  hypothetical protein  36 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  38.26 
 
 
268 aa  74.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  40.91 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  38.05 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  37.41 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  34.45 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  39.78 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  38.26 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  38.79 
 
 
271 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1745  hypothetical protein  42.55 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0889269  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  35.34 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  38.71 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3081  hypothetical protein  53.97 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  37.61 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  41.24 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  35.4 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  38.39 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  34.53 
 
 
275 aa  68.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  34.15 
 
 
273 aa  68.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  39.39 
 
 
277 aa  67.4  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  39.13 
 
 
271 aa  67.4  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  38.14 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  38.1 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  41.38 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  35.48 
 
 
280 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  40.54 
 
 
266 aa  64.7  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  35.71 
 
 
274 aa  64.3  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  35.92 
 
 
263 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  41.11 
 
 
283 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  36.09 
 
 
268 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  35.48 
 
 
270 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  40.57 
 
 
262 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  35.2 
 
 
271 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  37.5 
 
 
277 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  35.09 
 
 
278 aa  62.4  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  35.45 
 
 
272 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  34.65 
 
 
276 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  38.32 
 
 
263 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  34.88 
 
 
276 aa  62  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 
284 aa  60.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  36.94 
 
 
234 aa  60.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  37.61 
 
 
274 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  35.56 
 
 
283 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  39.36 
 
 
274 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  33.93 
 
 
269 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  36.27 
 
 
270 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  34.43 
 
 
276 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  32.17 
 
 
285 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  39.36 
 
 
266 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  37.12 
 
 
271 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  38.2 
 
 
266 aa  58.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  36.36 
 
 
333 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  37.17 
 
 
267 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  37.17 
 
 
298 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  43.01 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  30.85 
 
 
278 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  39.77 
 
 
267 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  38.55 
 
 
278 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  29.91 
 
 
323 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  32.14 
 
 
266 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  34.02 
 
 
265 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6764  hypothetical protein  80 
 
 
95 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  27.1 
 
 
272 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>