126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2708 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  65.13 
 
 
262 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  61.63 
 
 
271 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  60.47 
 
 
271 aa  310  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  59.39 
 
 
270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  56.92 
 
 
266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  54.3 
 
 
268 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  55.56 
 
 
275 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  59.13 
 
 
268 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  53.46 
 
 
266 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  54.69 
 
 
333 aa  291  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  54.69 
 
 
267 aa  291  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  54.26 
 
 
293 aa  288  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  51.91 
 
 
267 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  56.18 
 
 
270 aa  284  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  52.34 
 
 
268 aa  281  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  53.46 
 
 
274 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  54.47 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  53.52 
 
 
263 aa  268  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  47.1 
 
 
265 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  47.57 
 
 
290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  47.08 
 
 
280 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  42.21 
 
 
277 aa  222  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  45.56 
 
 
279 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  46.51 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  44.62 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  46.82 
 
 
302 aa  218  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  42.08 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  46.77 
 
 
288 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  42.75 
 
 
306 aa  205  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  40.23 
 
 
288 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  43.3 
 
 
283 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  44.92 
 
 
279 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  42.91 
 
 
267 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  43.51 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  40.22 
 
 
284 aa  191  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  42.54 
 
 
271 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  42.8 
 
 
253 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  43.81 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  38.27 
 
 
283 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  42.51 
 
 
266 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  41.6 
 
 
267 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  39.62 
 
 
272 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  47.93 
 
 
215 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  49.72 
 
 
182 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  41.18 
 
 
266 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  41.13 
 
 
276 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  41.15 
 
 
266 aa  185  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  39.08 
 
 
268 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  45.04 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  39.77 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  43.85 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  40.23 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  40.77 
 
 
264 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  39.21 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  40.5 
 
 
284 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  42.8 
 
 
284 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  40 
 
 
268 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  39.85 
 
 
279 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  40.31 
 
 
277 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  38.76 
 
 
265 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  38.17 
 
 
266 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  39.31 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  39.47 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  41.73 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  39.76 
 
 
269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  40.15 
 
 
280 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  39.66 
 
 
267 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  39.66 
 
 
269 aa  168  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  38.72 
 
 
275 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  40 
 
 
323 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  38.61 
 
 
272 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  40.73 
 
 
276 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  41.09 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  38.15 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  40.42 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  38.08 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  36.36 
 
 
277 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  34.85 
 
 
271 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  37.93 
 
 
268 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  38.22 
 
 
269 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  34.89 
 
 
328 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  37.81 
 
 
286 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  35.23 
 
 
274 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  37.31 
 
 
270 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  34.09 
 
 
278 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  38.4 
 
 
278 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  39.83 
 
 
282 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  37.74 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  36.33 
 
 
234 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  37.84 
 
 
277 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  36.54 
 
 
263 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  39.92 
 
 
298 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  37.5 
 
 
271 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  36.92 
 
 
283 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  34.29 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  33.58 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  36.23 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  34.43 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0769  protein of unknown function DUF574  34.14 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>