123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1644 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  673    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  57.36 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  57.41 
 
 
275 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  58.69 
 
 
262 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  56.27 
 
 
266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  58.2 
 
 
267 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  55.43 
 
 
274 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  54.69 
 
 
262 aa  291  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  57.42 
 
 
271 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  56.07 
 
 
268 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  56.25 
 
 
271 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  55.08 
 
 
268 aa  288  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  52.19 
 
 
293 aa  285  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  54.17 
 
 
270 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  53.33 
 
 
271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  55 
 
 
270 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  54.23 
 
 
268 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  51.76 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  53.26 
 
 
267 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  50.2 
 
 
268 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  45.85 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  46.38 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  49.43 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  46.56 
 
 
280 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  44.49 
 
 
279 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  47.89 
 
 
288 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  42.96 
 
 
277 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  45.91 
 
 
306 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  45.9 
 
 
283 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  44.06 
 
 
302 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  45 
 
 
273 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  43.35 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  40.25 
 
 
288 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  41.22 
 
 
279 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  44 
 
 
276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  44.94 
 
 
266 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  41.98 
 
 
267 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  46.31 
 
 
266 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  49.54 
 
 
215 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  44.79 
 
 
266 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  40.93 
 
 
267 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  42.98 
 
 
272 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  45.99 
 
 
252 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  40.88 
 
 
264 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  42.62 
 
 
283 aa  186  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  51.41 
 
 
182 aa  185  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  40.52 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  40.14 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  41.16 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  41.56 
 
 
267 aa  183  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  42.26 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  40.29 
 
 
272 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  42.74 
 
 
285 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  43.68 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  42.51 
 
 
276 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  41.46 
 
 
284 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  36.92 
 
 
271 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  38.64 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  40 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  41.67 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  42.26 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  41.87 
 
 
268 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  41 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  39.75 
 
 
280 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  38.31 
 
 
265 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  39.42 
 
 
277 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  39 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  39.75 
 
 
269 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  39.34 
 
 
270 aa  165  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  39.04 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  37.12 
 
 
234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  42.05 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  38.11 
 
 
272 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  38.98 
 
 
269 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  37.69 
 
 
275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  37.79 
 
 
268 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  36.33 
 
 
253 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  39.77 
 
 
273 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  39.17 
 
 
280 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  38 
 
 
274 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  39.34 
 
 
272 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  38.59 
 
 
328 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  36.97 
 
 
283 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  35.63 
 
 
278 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  40.09 
 
 
278 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  41.22 
 
 
274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  39.45 
 
 
277 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  40.17 
 
 
298 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  37.75 
 
 
276 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  39.58 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  35.92 
 
 
278 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  36.4 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  35.56 
 
 
273 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  36.65 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  35.77 
 
 
282 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  37.01 
 
 
263 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  34.73 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  35.25 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  35.92 
 
 
283 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  34.88 
 
 
272 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>