124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2845 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  537  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  78.24 
 
 
267 aa  407  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  51.54 
 
 
269 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  51.49 
 
 
268 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  49.43 
 
 
270 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  48.11 
 
 
266 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  50.2 
 
 
280 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  49.6 
 
 
271 aa  234  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  51.92 
 
 
268 aa  228  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  49.62 
 
 
271 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  49.14 
 
 
265 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  48.54 
 
 
274 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  49.03 
 
 
290 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  48.25 
 
 
272 aa  221  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  48.18 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  47.67 
 
 
266 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  46.78 
 
 
288 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  49.14 
 
 
266 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  47.97 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  47.73 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  47.27 
 
 
264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  45.8 
 
 
278 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  46.74 
 
 
266 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  44.91 
 
 
281 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  48.02 
 
 
279 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  46.33 
 
 
267 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  47.11 
 
 
286 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  47.98 
 
 
273 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  46.9 
 
 
288 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  46.58 
 
 
275 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  46.25 
 
 
276 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  44.92 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  58.43 
 
 
182 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  41.83 
 
 
266 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  44.54 
 
 
272 aa  198  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  47.28 
 
 
323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  44.02 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  46.32 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  42.86 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  47.62 
 
 
280 aa  195  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  45.83 
 
 
277 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  44.59 
 
 
268 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  46.12 
 
 
283 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  43.15 
 
 
277 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  43.75 
 
 
306 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  43.7 
 
 
283 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  46.15 
 
 
252 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  41.48 
 
 
272 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  42.53 
 
 
276 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  53.37 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  45.12 
 
 
277 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  42.25 
 
 
253 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  42.31 
 
 
266 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  41.45 
 
 
279 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  41 
 
 
267 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  38.89 
 
 
302 aa  185  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  43.18 
 
 
277 aa  184  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  40.52 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  43.4 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  44.4 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  41.18 
 
 
268 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  39.69 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  41.95 
 
 
284 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  42.37 
 
 
274 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  41.7 
 
 
268 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  46.41 
 
 
271 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  41.6 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  43.97 
 
 
234 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  42.06 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  40.73 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  42.48 
 
 
276 aa  178  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  39.69 
 
 
285 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  40.78 
 
 
273 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  41.35 
 
 
283 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  38.75 
 
 
284 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  40.31 
 
 
270 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  40.83 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  40.7 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  43.53 
 
 
263 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  38.78 
 
 
284 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  38.79 
 
 
293 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  39.49 
 
 
269 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  40.34 
 
 
283 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  39.66 
 
 
262 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  42.62 
 
 
280 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  39.71 
 
 
266 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  40.95 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  37.3 
 
 
270 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  36.63 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  40.54 
 
 
274 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  38.15 
 
 
271 aa  161  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  38.94 
 
 
278 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  39.83 
 
 
277 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  37.19 
 
 
278 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  39.66 
 
 
263 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0769  protein of unknown function DUF574  36.78 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  42.68 
 
 
298 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  39.77 
 
 
267 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  34.36 
 
 
265 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  39.38 
 
 
272 aa  148  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>