121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  100 
 
 
276 aa  559  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  62.03 
 
 
277 aa  322  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  43.91 
 
 
268 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  42.86 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  42.65 
 
 
269 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  43.31 
 
 
272 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  41.33 
 
 
281 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  40.74 
 
 
266 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  42.86 
 
 
266 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  42.49 
 
 
268 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  41.79 
 
 
266 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  42.86 
 
 
267 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  42.22 
 
 
272 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  41.35 
 
 
253 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  42.19 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  41.67 
 
 
271 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  39.34 
 
 
265 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  42.48 
 
 
269 aa  178  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  39.71 
 
 
276 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  42.57 
 
 
234 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  40.96 
 
 
323 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  43.4 
 
 
267 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  43.18 
 
 
264 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  41.2 
 
 
268 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  39.58 
 
 
273 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  40.77 
 
 
286 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  38.52 
 
 
266 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  40.66 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  41.88 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  39.76 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  38.61 
 
 
288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  38.87 
 
 
283 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  37.17 
 
 
267 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  37.78 
 
 
272 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  37.83 
 
 
277 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  41.34 
 
 
277 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  40.07 
 
 
280 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  42 
 
 
279 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  40.62 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  39.78 
 
 
268 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  38.58 
 
 
263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  36.58 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  39.93 
 
 
274 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  38.27 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  35.51 
 
 
278 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  40.15 
 
 
280 aa  162  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  39.31 
 
 
288 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  38.35 
 
 
271 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  37.9 
 
 
273 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  40.16 
 
 
275 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  36.94 
 
 
279 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  39.92 
 
 
279 aa  158  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  36.16 
 
 
293 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  39.78 
 
 
266 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  38.93 
 
 
290 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  37.75 
 
 
333 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  36.82 
 
 
283 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  36.55 
 
 
284 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  35.74 
 
 
268 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  39.15 
 
 
275 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  42.86 
 
 
269 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  40.35 
 
 
252 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  37.89 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  38.01 
 
 
270 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  39.71 
 
 
266 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  37.31 
 
 
267 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  34.18 
 
 
277 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  37.18 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  36.57 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  38.1 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  37.59 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  34.21 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  35 
 
 
277 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  39.42 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  36.33 
 
 
268 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  32.26 
 
 
265 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  42.57 
 
 
215 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  35.63 
 
 
283 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  34.77 
 
 
279 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  34.83 
 
 
267 aa  141  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  35.36 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  36.26 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  34.66 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  35.34 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  34.56 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  36.05 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  35.16 
 
 
302 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  37.07 
 
 
271 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  36.94 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  35.66 
 
 
285 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  33.86 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  35.8 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  34.25 
 
 
284 aa  131  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  34.7 
 
 
272 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  34.63 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  39.89 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  32.01 
 
 
280 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  35.38 
 
 
278 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 
284 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>