128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1614 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  70.96 
 
 
288 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  68.63 
 
 
279 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  66.16 
 
 
290 aa  348  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  65.94 
 
 
252 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  63.02 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  66.98 
 
 
215 aa  301  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  56.3 
 
 
279 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  78.45 
 
 
182 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  56.59 
 
 
277 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  55.81 
 
 
279 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  54.92 
 
 
302 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  55.34 
 
 
273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  52.71 
 
 
268 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  48.15 
 
 
288 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  51.16 
 
 
275 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  51.15 
 
 
268 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  48.7 
 
 
272 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  50.58 
 
 
271 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  51.36 
 
 
268 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  50.39 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  50 
 
 
293 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  50.38 
 
 
270 aa  241  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  49.23 
 
 
266 aa  241  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  51.15 
 
 
264 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  50.2 
 
 
269 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  48.85 
 
 
267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  50.39 
 
 
271 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  45.11 
 
 
268 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  47.08 
 
 
262 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  49.61 
 
 
270 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  46.3 
 
 
266 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  48.81 
 
 
268 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  49.43 
 
 
279 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  47.39 
 
 
263 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  49.23 
 
 
268 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  48.67 
 
 
267 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  46.56 
 
 
333 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  47.43 
 
 
262 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  43.56 
 
 
277 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  49.81 
 
 
277 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  47.57 
 
 
272 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  43.07 
 
 
265 aa  221  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  45.08 
 
 
265 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3639  hypothetical protein  65.22 
 
 
169 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  47.31 
 
 
283 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  48.25 
 
 
271 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  49.59 
 
 
266 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  48.51 
 
 
269 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  42.09 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  48.57 
 
 
266 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  48.75 
 
 
266 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  44.81 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  46.79 
 
 
280 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  43.82 
 
 
266 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  44.14 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  44.91 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  50 
 
 
271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  45.2 
 
 
276 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  44.16 
 
 
268 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  44.79 
 
 
274 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  44.86 
 
 
283 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  44.78 
 
 
270 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  44.29 
 
 
277 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  43.64 
 
 
284 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  58.19 
 
 
214 aa  205  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  45.93 
 
 
266 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  42.34 
 
 
271 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  43.36 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  43.41 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  46.04 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  43.72 
 
 
286 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  45.21 
 
 
267 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  40.43 
 
 
273 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  41.35 
 
 
253 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  43.03 
 
 
263 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  43.33 
 
 
284 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  40.22 
 
 
269 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  39.93 
 
 
277 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  39.92 
 
 
274 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  43.19 
 
 
273 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  41.25 
 
 
269 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  42.55 
 
 
278 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  43.46 
 
 
328 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  40.07 
 
 
277 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  41.8 
 
 
285 aa  185  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  39.5 
 
 
284 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  43.68 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3635  hypothetical protein  78.1 
 
 
133 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  39.39 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  43.46 
 
 
234 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  38.06 
 
 
272 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  36.47 
 
 
283 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  39.55 
 
 
323 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  36.71 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2723  hypothetical protein  72.97 
 
 
144 aa  171  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.979081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  40.84 
 
 
277 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  39.84 
 
 
280 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4030  hypothetical protein  55.21 
 
 
173 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0569  hypothetical protein  69.09 
 
 
142 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>