125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3624 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  60.82 
 
 
270 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  61.2 
 
 
268 aa  311  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  58.2 
 
 
275 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  54.51 
 
 
271 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  53.18 
 
 
268 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  55.69 
 
 
266 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  55.12 
 
 
271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  53.88 
 
 
266 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  53.67 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  55.34 
 
 
267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  53.52 
 
 
262 aa  268  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  52.9 
 
 
293 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  51.76 
 
 
333 aa  265  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  53.46 
 
 
268 aa  265  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  53.44 
 
 
262 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  53.91 
 
 
271 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  53.46 
 
 
270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  49.8 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  49.42 
 
 
273 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  47.39 
 
 
280 aa  227  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  46.56 
 
 
265 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  48.08 
 
 
279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  46.01 
 
 
267 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  47.13 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  45.39 
 
 
288 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  43.07 
 
 
279 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  42.64 
 
 
277 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  39.23 
 
 
279 aa  198  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  44.06 
 
 
268 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  41.45 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  55.11 
 
 
182 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  45.38 
 
 
280 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  51.39 
 
 
215 aa  195  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  42.97 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  44.03 
 
 
268 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  43.51 
 
 
284 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  45.27 
 
 
267 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  45.75 
 
 
266 aa  188  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  41.31 
 
 
275 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  44.44 
 
 
266 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  43.8 
 
 
269 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  40.84 
 
 
288 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  43.48 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  41.25 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  39.59 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  41.95 
 
 
306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  41.06 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  41.47 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  43.9 
 
 
266 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  42.26 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  38.57 
 
 
286 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  39.7 
 
 
264 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  41.29 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  39.23 
 
 
281 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  39.53 
 
 
277 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  40.22 
 
 
272 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  39.29 
 
 
285 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  40.53 
 
 
267 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  39.6 
 
 
284 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  40.23 
 
 
272 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  38.4 
 
 
266 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  39.83 
 
 
274 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  40.84 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  40.84 
 
 
323 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  40.51 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  41.32 
 
 
267 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  42.28 
 
 
277 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  41.15 
 
 
280 aa  168  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  41.77 
 
 
268 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  40.64 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  41.22 
 
 
277 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  39.83 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  42.91 
 
 
276 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  39.59 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  39.93 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  38.8 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  41.13 
 
 
263 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  37.04 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  36.29 
 
 
274 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  37.85 
 
 
271 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  37.2 
 
 
278 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  39.27 
 
 
277 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  39.66 
 
 
269 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  39.36 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  37.5 
 
 
269 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  37.87 
 
 
278 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  37.12 
 
 
270 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  40.82 
 
 
271 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  37.89 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0769  protein of unknown function DUF574  35.91 
 
 
295 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  36.4 
 
 
283 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  36.48 
 
 
328 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  36.78 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  35.16 
 
 
273 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  36.79 
 
 
282 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  35.1 
 
 
283 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  37.69 
 
 
277 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  31.64 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>