112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1745 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1745  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0889269  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1516  hypothetical protein  52.15 
 
 		 161 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  51.46 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  49.14 
 
 		 280 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  46.29 
 
 		 277 aa  138  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3639  hypothetical protein  48.26 
 
 		 169 aa  137  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  48.03 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  43.93 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  49.12 
 
 		 273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  48.28 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  46.2 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  49.7 
 
 		 288 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  46.33 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  45.51 
 
 		 266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  43.21 
 
 		 268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  46.24 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  46.2 
 
 		 275 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  46.63 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  44.51 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  46.78 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  44.97 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  43.86 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  46.67 
 
 		 302 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  44.64 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  45.4 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4030  hypothetical protein  43.6 
 
 		 173 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  40.94 
 
 		 262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  43.05 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  44.12 
 
 		 266 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  45.73 
 
 		 279 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  39.38 
 
 		 274 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  42.51 
 
 		 279 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  39.75 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  46.56 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  40 
 
 		 262 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  40 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  42.41 
 
 		 271 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  39.88 
 
 		 333 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  42.94 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  42.68 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  42.77 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  43.27 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  35.33 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  44.97 
 
 		 283 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  39.77 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  43.93 
 
 		 279 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  39.11 
 
 		 272 aa  104  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  63.44 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  38.18 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  40.12 
 
 		 272 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  37.89 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  41.28 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  38.38 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  43.66 
 
 		 268 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  40.85 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  41.14 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  37.57 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  42.76 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0403  hypothetical protein  43.57 
 
 		 148 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  39.66 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  38.32 
 
 		 267 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  41.77 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  38.41 
 
 		 284 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  42.66 
 
 		 277 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  39.31 
 
 		 272 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  36.36 
 
 		 269 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  37.43 
 
 		 277 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  34.12 
 
 		 269 aa  91.7  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  32.56 
 
 		 273 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  39.39 
 
 		 268 aa  91.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  39.39 
 
 		 269 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  39.16 
 
 		 280 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  41.06 
 
 		 276 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  33.96 
 
 		 278 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  35.96 
 
 		 277 aa  88.2  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  32.89 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  37.41 
 
 		 277 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  32.35 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  39.1 
 
 		 263 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  35.85 
 
 		 276 aa  85.1  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  34.84 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  36.14 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  36.21 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  33.14 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  34.87 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  34.76 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  35.1 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  33.53 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  36.36 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  38.52 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  34.09 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  33.77 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  33.77 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3527  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672122  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  35.2 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  37.29 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  32.77 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  35.62 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>