101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3527 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3527  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  157  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672122  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  68.92 
 
 		 214 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  68.92 
 
 		 252 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  64.86 
 
 		 288 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3639  hypothetical protein  62.16 
 
 		 169 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  61.25 
 
 		 215 aa  94  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  57.69 
 
 		 306 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  58.11 
 
 		 280 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  59.46 
 
 		 290 aa  87  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  50.63 
 
 		 279 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  56.25 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0403  hypothetical protein  56.76 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  51.9 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  57.5 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1516  hypothetical protein  47.5 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1745  hypothetical protein  51.28 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0889269  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4030  hypothetical protein  49.37 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  47.3 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  47.3 
 
 		 279 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  47.22 
 
 		 288 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  47.3 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  47.3 
 
 		 263 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  42.31 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  40.51 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  48.61 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  42.31 
 
 		 268 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  48.1 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  41.56 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  46.25 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  38.75 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  43.24 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  54.24 
 
 		 266 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  39.19 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  41.77 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  41.03 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  43.24 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  45.83 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  36.71 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  44.59 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  44.74 
 
 		 264 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  40.54 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  41.03 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  43.04 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  44.59 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  40.3 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  34.62 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  42.86 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  34.21 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  37.5 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  37.18 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  42.31 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  37.84 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  34.62 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  36 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  37.33 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  45.95 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  42.31 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  36 
 
 		 281 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  41.03 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  39.74 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  39.74 
 
 		 271 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  36.36 
 
 		 269 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  34.18 
 
 		 283 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  36.99 
 
 		 271 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  39.13 
 
 		 275 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  36.71 
 
 		 283 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  46.38 
 
 		 298 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  37.18 
 
 		 277 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  34.62 
 
 		 285 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  38.36 
 
 		 270 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  41.03 
 
 		 276 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  37.97 
 
 		 273 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  43.66 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  38.03 
 
 		 278 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  34.62 
 
 		 328 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  34.67 
 
 		 277 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  35.29 
 
 		 277 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  35.44 
 
 		 273 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  41.56 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  33.78 
 
 		 276 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  38.03 
 
 		 267 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  38.89 
 
 		 272 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 		 274 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  40.85 
 
 		 263 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  35.9 
 
 		 286 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  41.89 
 
 		 269 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  35.8 
 
 		 282 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  38.98 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 		 284 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  30.77 
 
 		 265 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  34.94 
 
 		 267 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  35.8 
 
 		 274 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  36.11 
 
 		 234 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  31.08 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  38.71 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  30.77 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  32.5 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  25.97 
 
 		 283 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  35 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>