125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4399 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  65.94 
 
 
280 aa  317  9e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  62.3 
 
 
288 aa  298  6e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  65.67 
 
 
290 aa  292  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  60.32 
 
 
279 aa  291  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  58.61 
 
 
306 aa  278  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  57.21 
 
 
279 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  54.08 
 
 
277 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  67.96 
 
 
182 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  54.19 
 
 
279 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  56.33 
 
 
302 aa  248  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0569  hypothetical protein  96.72 
 
 
142 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  51.97 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  51.54 
 
 
273 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  49.79 
 
 
268 aa  221  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  48.25 
 
 
293 aa  214  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  48.89 
 
 
266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  60.77 
 
 
215 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  45.99 
 
 
270 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  49.1 
 
 
271 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  49.1 
 
 
268 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  48.02 
 
 
272 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  48.44 
 
 
264 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  43.83 
 
 
265 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  46.93 
 
 
268 aa  201  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  46.7 
 
 
270 aa  201  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  48.89 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  48 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  47.3 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  48.68 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  47.51 
 
 
267 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  46.03 
 
 
283 aa  198  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  45.34 
 
 
281 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  43.42 
 
 
274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  48.05 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  48.48 
 
 
266 aa  195  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  48.8 
 
 
286 aa  195  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  43.24 
 
 
273 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  50.25 
 
 
284 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  45.41 
 
 
277 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  50 
 
 
263 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  47.53 
 
 
283 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  46.15 
 
 
269 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  45.76 
 
 
266 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  45.22 
 
 
268 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  45.42 
 
 
276 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  47.16 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  43.81 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  44.26 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  46.46 
 
 
271 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  46.05 
 
 
279 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  49.76 
 
 
271 aa  188  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  44.4 
 
 
275 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  44.4 
 
 
268 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  43.36 
 
 
285 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  45.99 
 
 
333 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  42.31 
 
 
266 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  46.12 
 
 
272 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  44.92 
 
 
267 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  43.23 
 
 
280 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  42.6 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  45.45 
 
 
266 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  40.85 
 
 
328 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  41.56 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  42.08 
 
 
253 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  44.25 
 
 
283 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  41.53 
 
 
277 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  44.98 
 
 
271 aa  178  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  48.31 
 
 
267 aa  178  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  42.48 
 
 
284 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  43.24 
 
 
274 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  46.12 
 
 
266 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  44.07 
 
 
276 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  44.39 
 
 
263 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  48.92 
 
 
267 aa  175  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  42.62 
 
 
269 aa  174  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  41.88 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  40.97 
 
 
283 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  43.56 
 
 
274 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  43.1 
 
 
323 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3635  hypothetical protein  71.3 
 
 
133 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  40.99 
 
 
284 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  39.48 
 
 
269 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  38.56 
 
 
265 aa  168  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2723  hypothetical protein  63.08 
 
 
144 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.979081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  38.7 
 
 
277 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  47.16 
 
 
269 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  42.48 
 
 
272 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  38.2 
 
 
278 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  40.08 
 
 
278 aa  164  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  43.15 
 
 
271 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  43.81 
 
 
280 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  43.58 
 
 
267 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  41.28 
 
 
298 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  40.35 
 
 
276 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  41.63 
 
 
234 aa  151  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  42.13 
 
 
273 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  39.51 
 
 
277 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  40.89 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>