122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1360 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  93.01 
 
 
272 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  53.01 
 
 
268 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  51.39 
 
 
266 aa  262  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  49.26 
 
 
270 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  50 
 
 
271 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  50.19 
 
 
269 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  49.05 
 
 
274 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  46.27 
 
 
278 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  47.15 
 
 
277 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  46.01 
 
 
272 aa  225  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  45.91 
 
 
268 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  48.02 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  48.57 
 
 
280 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  43.35 
 
 
283 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  42.14 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  45.12 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  42.8 
 
 
272 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  44.44 
 
 
281 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  45.8 
 
 
279 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  43.7 
 
 
284 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  44.32 
 
 
266 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  42.7 
 
 
267 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  41.7 
 
 
265 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  48.28 
 
 
269 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  43.35 
 
 
267 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  45.9 
 
 
266 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  44.19 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  44.57 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  44.11 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  40.62 
 
 
253 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  43.68 
 
 
273 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  43.19 
 
 
268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  43.51 
 
 
263 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  43.6 
 
 
276 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  42.47 
 
 
288 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  41.22 
 
 
272 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  46.53 
 
 
266 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  44.63 
 
 
275 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  43.49 
 
 
270 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  41.38 
 
 
274 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  44.62 
 
 
273 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  44.03 
 
 
266 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  41.51 
 
 
268 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  45.61 
 
 
283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  40.98 
 
 
274 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  39.47 
 
 
278 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  43.85 
 
 
276 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  42.97 
 
 
271 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  37.97 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  40.96 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  42.52 
 
 
271 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  39.7 
 
 
273 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  42.39 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  40.3 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  45.02 
 
 
298 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  39.55 
 
 
280 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  40.46 
 
 
269 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  40.47 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  40.08 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  42.15 
 
 
267 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  38.91 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  41.89 
 
 
288 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  40.84 
 
 
263 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  43.15 
 
 
266 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  43.27 
 
 
268 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  41.57 
 
 
290 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  37.55 
 
 
279 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  39.84 
 
 
279 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  40.46 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  39.31 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  37.41 
 
 
293 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  41.67 
 
 
279 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  43.1 
 
 
252 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  39.7 
 
 
284 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  40.61 
 
 
262 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  37.36 
 
 
280 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  39.62 
 
 
275 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  39.04 
 
 
333 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  39.69 
 
 
234 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  39.54 
 
 
302 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  40 
 
 
271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  36.22 
 
 
272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  40.44 
 
 
271 aa  165  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  37.55 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  37.66 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  38.34 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0769  protein of unknown function DUF574  38.93 
 
 
295 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  42.28 
 
 
262 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  35.36 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  41.92 
 
 
328 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  38.87 
 
 
274 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  39.76 
 
 
277 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  37.9 
 
 
270 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  37.89 
 
 
269 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  34.96 
 
 
265 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  39.66 
 
 
284 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  37.97 
 
 
271 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  37.84 
 
 
267 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3589  protein of unknown function DUF574  40 
 
 
277 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.801624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>