More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2075 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2075  aminotransferase  100 
 
 		 461 aa  911    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.618843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2067  aminotransferase  46.51 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  39.28 
 
 		 451 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  36.82 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  36.82 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  36.82 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  36.82 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  36.82 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  36.82 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  36.58 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  36.82 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  36.82 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  36.58 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  36.34 
 
 		 436 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  33.8 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  35.9 
 
 		 443 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  36.04 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  33.26 
 
 		 440 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  33.49 
 
 		 442 aa  210  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  33.64 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.14 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.12 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  32.57 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  32.57 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  32.57 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  32.57 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  32.57 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  32.57 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  32.78 
 
 		 445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  32.57 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  28.18 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  35.15 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  33.41 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  33.03 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  33.41 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  35.48 
 
 		 442 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  31.24 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  32.71 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  31.93 
 
 		 450 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  33.02 
 
 		 442 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  33.01 
 
 		 457 aa  193  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  35.25 
 
 		 442 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  34.56 
 
 		 442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  29.79 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  33.26 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  32.13 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  34.52 
 
 		 455 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  32.23 
 
 		 441 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  30.79 
 
 		 449 aa  190  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  31.74 
 
 		 448 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  32.4 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  29.69 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0894  beta alanine--pyruvate transaminase  32.21 
 
 		 447 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  33.8 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  31.49 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  33.18 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00471  beta alanine--pyruvate transaminase  35.73 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  29.41 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  32.87 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  32.87 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  29.5 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  32.55 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  31.55 
 
 		 479 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0936  beta alanine--pyruvate transaminase  31.65 
 
 		 446 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1114  beta alanine--pyruvate transaminase  31.87 
 
 		 445 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  36.63 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  31.92 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  30 
 
 		 449 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  33.09 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  32.03 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  30.9 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3861  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  29.91 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  32.8 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3951  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  29.61 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.68 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4028  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  28.94 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  32.4 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  29.69 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  32.01 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4341  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  28.94 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  30.57 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  31.09 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  30.99 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  29.69 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3875  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  30.14 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  32.57 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  29.45 
 
 		 449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  34.95 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  29.69 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  29.95 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  30 
 
 		 448 aa  183  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  33.61 
 
 		 462 aa  183  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  30.35 
 
 		 457 aa  183  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.66 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  29.45 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2537  beta alanine--pyruvate transaminase  31.56 
 
 		 445 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  29.45 
 
 		 450 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  29.77 
 
 		 456 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  29.77 
 
 		 456 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>