More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2067 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2067  aminotransferase  100 
 
 		 424 aa  858    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2075  aminotransferase  46.51 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.618843 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  29.55 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  28.1 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  27.87 
 
 		 436 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  27.87 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  27.87 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  27.87 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  27.87 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  27.87 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  27.63 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  27.63 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  27.4 
 
 		 436 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  27.49 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  27.87 
 
 		 455 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  28.17 
 
 		 479 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  29.35 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  29.35 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  29.35 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  29.35 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  29.12 
 
 		 448 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  29.7 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  29.12 
 
 		 448 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  29.12 
 
 		 448 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  28.22 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  28.06 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  25.93 
 
 		 444 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  25.57 
 
 		 443 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  27.48 
 
 		 445 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  26.34 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  27.31 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  25.95 
 
 		 446 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  27.92 
 
 		 446 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  25.95 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  26.79 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  25.6 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  25.95 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  25.95 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  28.88 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  26.82 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  27.11 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  26.79 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  26.22 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3951  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  24.35 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3861  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  24.82 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  27.33 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  28.13 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  25.48 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  26.88 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4189  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  24 
 
 		 462 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4253  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  24 
 
 		 462 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4028  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  24.12 
 
 		 462 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4341  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  24.12 
 
 		 462 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  25.48 
 
 		 446 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  24.24 
 
 		 459 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3875  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  24.36 
 
 		 462 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4230  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  25.18 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.769932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  28.75 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  26.88 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  28.5 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.5 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4143  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  24.59 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  25.77 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  26.35 
 
 		 443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  27.11 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  27.09 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  27.92 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  27.21 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2818  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  23.23 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  28.5 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  27.11 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  28.5 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  27.52 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  28.5 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1007  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  25.18 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  25.71 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  28.11 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  27.75 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  27.04 
 
 		 442 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  25.24 
 
 		 446 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  26.12 
 
 		 450 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  27.7 
 
 		 465 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  27.93 
 
 		 465 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  27.7 
 
 		 465 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  28.32 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  27.7 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  27.01 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  26.76 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  23.73 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  26.2 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  27.14 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  25.17 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  26.46 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  25.41 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  26.09 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  27.55 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  26.79 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  26.09 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  26.46 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  25.17 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>