135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2055 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2055  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0374484  normal  0.316052 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.03 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.8 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  32.32 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.97 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.87 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  28.69 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  33.56 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.78 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  26.56 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  23.39 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  23.83 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  28.83 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  28.83 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  29.73 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  37.6 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  26.56 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  28.83 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  29.73 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  29.73 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.43 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.48 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  29.73 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  23.83 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  25.47 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.96 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  28.7 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  28.7 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  28.7 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  28.7 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  28.7 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  28.7 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  25.52 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  25.52 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  28.7 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  33.93 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.32 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  32.74 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  27.62 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  28.46 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  27.78 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.78 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  28.57 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  27.78 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  27.78 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  27.78 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  26.79 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  26.79 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  26.79 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  25.19 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.95 
 
 		 349 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  38.64 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.43 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.53 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  26.03 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  45.71 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  26.75 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.63 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.37 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0713  hypothetical protein  29.5 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.11 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  26.13 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.86 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  25 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  24.81 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  34.72 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  34.95 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1984  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.36 
 
 		 181 aa  45.4  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.911586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.45 
 
 		 222 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.83 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1936  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.65 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  44.87 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  34.72 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0765  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.38 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  25.69 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1799  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  27.98 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  34.68 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000876  probable hydrolase  27.64 
 
 		 155 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.61 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.11 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  27.83 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  27.34 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.06 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.5 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  26.96 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  27.97 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  34.26 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  31.54 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.91 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  31.54 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  30.56 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  34.21 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>