More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2131 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2131  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 414 aa  853    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.594971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12553  Cys/Met metabolism lyase (PLP-dependent)  82.66 
 
 		 399 aa  701    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.184817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  40.97 
 
 		 377 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  36.56 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  37.17 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  39.02 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  39.02 
 
 		 377 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  39.02 
 
 		 377 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  39.02 
 
 		 377 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  38.21 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  39.02 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  39.02 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  36.68 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  38.75 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  38.75 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  38.75 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  37.82 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.03 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  37.31 
 
 		 413 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.39 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  35.6 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.39 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  36.17 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  38.75 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  37.06 
 
 		 397 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  39.02 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  35.86 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  36.6 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  36.46 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  36.9 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.97 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  36.49 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0766  cystathionine beta-lyase  37.33 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  37.43 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  35.49 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  36.6 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  37.5 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  36.6 
 
 		 397 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  34.82 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  36.34 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  36.01 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.74 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  36.71 
 
 		 398 aa  223  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.36 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.7 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 		 392 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  36.43 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.37 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  38.87 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  36.1 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  36.44 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.33 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.5 
 
 		 403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.74 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1237  cystathionine gamma-synthase  37.29 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  36.05 
 
 		 381 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  38.02 
 
 		 385 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  36.57 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.49 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.02 
 
 		 403 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.13 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  36.13 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  37.4 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  33.24 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  37.82 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  36.78 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  35.58 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.44 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  36.59 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  38.66 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  35.52 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.42 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1804  cystathionine beta-lyase  35.89 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.699729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  34.76 
 
 		 381 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  34.86 
 
 		 396 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.42 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  36.26 
 
 		 388 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  37.69 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  34.16 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  38.82 
 
 		 386 aa  216  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.43 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.44 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.4 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.31 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  35.88 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  32.1 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  35.62 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.73 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  35.12 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  35.97 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.2 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  37.13 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  36.52 
 
 		 378 aa  213  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.44 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  35.31 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  35.56 
 
 		 393 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.19 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.15 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.84 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  37.94 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>