57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4779 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  178  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  178  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  41.67 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  36.25 
 
 
112 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  33.75 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  35.44 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  36 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  36.71 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  35.37 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  35.37 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  35.37 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  35.37 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  35.53 
 
 
92 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  33.73 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  35.9 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  37.66 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  30.49 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  32.91 
 
 
92 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  31.58 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  31.82 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  33.75 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  32.1 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3387  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  32.1 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  29.49 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  30 
 
 
112 aa  47.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  31.17 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  41.82 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  28.92 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  28.4 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  31.17 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  30 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  35.23 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0462  hypothetical protein  32.1 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00382  hypothetical protein  32.1 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00876967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0467  hypothetical protein  32.1 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62565  normal  0.624691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  31.65 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00378  conserved hypothetical protein  32.1 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00680553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0502  hypothetical protein  32.1 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.145396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  29.89 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  29.73 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  31.17 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  28.21 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  28.75 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  28.75 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  34.62 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  28.75 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  29.11 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  28.38 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0915  hypothetical protein  35.09 
 
 
90 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0663425  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0764  hypothetical protein  35.09 
 
 
90 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  32.88 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>