32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4967 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  58.14 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  45.16 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  41.38 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  35.37 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  37.66 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  37.66 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  37.08 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  35.96 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  36.36 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  37.8 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  33.77 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  32.93 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  41.51 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  35.14 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  32.89 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  32.89 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  32.94 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  29.87 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  29.87 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  29.87 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  29.87 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  32.94 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  34.62 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  33.73 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  33.77 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  37.93 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  34.88 
 
 		 93 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  39.02 
 
 		 89 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  34.83 
 
 		 97 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  39.02 
 
 		 89 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>