43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2321 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 92 aa  179  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  69.23 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  52.17 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  52.17 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  52.17 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  52.17 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  54.95 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  53.26 
 
 		 92 aa  95.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  49.44 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  46.05 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  45.21 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  45.07 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  45.83 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  40.79 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  37.33 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  32.89 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  34.94 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  36.78 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  31.17 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  32.89 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  39.47 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  37.18 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  36.62 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  32.93 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  35.53 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  33.77 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  36.49 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  42.11 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  34.29 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  30.77 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  39.44 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1985  hypothetical protein  31.33 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  33.78 
 
 		 104 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  32.88 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  37.33 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  31.58 
 
 		 99 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>