58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1482 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  225  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  75 
 
 		 113 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  87.36 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  68.14 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  49.38 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  47.73 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  48.19 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  41.76 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  44.44 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  43.21 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  43.21 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  43.21 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  40.48 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0280  hypothetical protein  46.67 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  42.17 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  38.55 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  42.17 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  43.21 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  42.68 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  42.68 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  42.35 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  38.46 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  41.46 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1355  hypothetical protein  44.32 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  37.21 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3083  Protein of unknown function DUF1778  40 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3548  Protein of unknown function DUF1778  38.82 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3430  Protein of unknown function DUF1778  38.82 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.410237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  41.33 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4572  hypothetical protein  37.65 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0336291  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4712  hypothetical protein  37.65 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4663  hypothetical protein  37.65 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.316617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  35.44 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  35.44 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  35.37 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  32.1 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5374  Protein of unknown function DUF1778  36.14 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0668573  normal  0.988789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  39.19 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  32.1 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  43.18 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  30.86 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  31.37 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  36 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  32.53 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  26.25 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1985  hypothetical protein  35.44 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  27.85 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  32.89 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  31.65 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  28.74 
 
 		 114 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  32.94 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  35.37 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  30.93 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  31.94 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  28.92 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>