36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12817 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  8e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  43.75 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  42.86 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3387  hypothetical protein  34.57 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  36.49 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  39.19 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  29.85 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  41.86 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  31.17 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  31.17 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0467  hypothetical protein  32.98 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62565  normal  0.624691 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  34.62 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  35.8 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  40.79 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  40.62 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00382  hypothetical protein  28.83 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00876967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00378  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00680553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0502  hypothetical protein  28.83 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.145396  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0462  hypothetical protein  28.83 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129504  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  37.18 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  37.18 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  40.54 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  36.14 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  40.24 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  34.72 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  29.11 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  35.53 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  33.33 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  37.5 
 
 		 92 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0400  Protein of unknown function DUF1778  31.82 
 
 		 98 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00028613  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  31.76 
 
 		 90 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  35.9 
 
 		 92 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  32.05 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>