43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2077 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  70.65 
 
 		 93 aa  123  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  46.07 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  43.68 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0400  Protein of unknown function DUF1778  39.76 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00028613  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  43.53 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  41.33 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  34.52 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  38.67 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  36.49 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  36.49 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  38.1 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  35.44 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  34.18 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  34.18 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  34.18 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  34.18 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  34.18 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  31.58 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  37.31 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  31.58 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  38.27 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  32 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  29.41 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  27.85 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  35.14 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  34.94 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1171  CopG-like DNA-binding  33.33 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.693906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  30.49 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  32.43 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  32.84 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  35.9 
 
 		 155 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0837  hypothetical protein  30.38 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346325 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  28.4 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  32.43 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  32.43 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  32.43 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  31.34 
 
 		 92 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  32.56 
 
 		 97 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>