44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4726 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  182  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  84.78 
 
 
92 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  83.7 
 
 
92 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  67.39 
 
 
90 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  69.05 
 
 
83 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  52.87 
 
 
90 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  52.87 
 
 
90 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  48.86 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  44.83 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  48.19 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  48.19 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  48.19 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  48.19 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  46.67 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  46.99 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  50 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  48.19 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  46.99 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  43.82 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  38.64 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1355  hypothetical protein  44.94 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  42.68 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3548  Protein of unknown function DUF1778  44.44 
 
 
97 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  37.08 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4663  hypothetical protein  42.53 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.316617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4712  hypothetical protein  42.53 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0574447  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5374  Protein of unknown function DUF1778  37.93 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0668573  normal  0.988789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4572  hypothetical protein  41.38 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0336291  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  35.96 
 
 
99 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  35.96 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3083  Protein of unknown function DUF1778  43.33 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0280  hypothetical protein  42.22 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3430  Protein of unknown function DUF1778  43.18 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.410237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  40.48 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  39.76 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  41.1 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  37.31 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  37.88 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  36.99 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  38.1 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  32.84 
 
 
92 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>