62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0918 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 96 aa  193  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  42.05 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  43.37 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  43.37 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  43.37 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  44.44 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  42.17 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  39.29 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  39.77 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  37.65 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  39.77 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  38.64 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  36.96 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  41.94 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  36.9 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  31.76 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  35.63 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  34.52 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  36.36 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  36.62 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  36.25 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  35.21 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  32.97 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  35.21 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  36.25 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  32.94 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  32.98 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  38.27 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  31.87 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0400  Protein of unknown function DUF1778  32.63 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00028613  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  31.37 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  36.62 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  36.11 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3548  Protein of unknown function DUF1778  32.63 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3430  Protein of unknown function DUF1778  32.63 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.410237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3083  Protein of unknown function DUF1778  32.63 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  32.47 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  33.75 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  35 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  34.04 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4712  hypothetical protein  34.15 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4572  hypothetical protein  34.15 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0336291  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4663  hypothetical protein  34.15 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.316617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  31.58 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  28.89 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  32.53 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  33.01 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  28.21 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  28.21 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  30.34 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1355  hypothetical protein  32.63 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  30.67 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  23.66 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  28.24 
 
 		 116 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  27.71 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  33.8 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0280  hypothetical protein  33.71 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  29.11 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  29.11 
 
 		 90 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>