58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4102 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 112 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  75 
 
 		 113 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  68.75 
 
 		 113 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  71.58 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  51.25 
 
 		 83 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  50 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  48.24 
 
 		 92 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  41.49 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  43.21 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  43.21 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  43.21 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  43.21 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  38.14 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  43.21 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0280  hypothetical protein  46.07 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  50.79 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  38.55 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  50.79 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  43.37 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  43.37 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  43.37 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  37.08 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1355  hypothetical protein  38.83 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  42.68 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  40.48 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3548  Protein of unknown function DUF1778  39.33 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3083  Protein of unknown function DUF1778  39.33 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  36.25 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3430  Protein of unknown function DUF1778  38.04 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.410237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  36.25 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4663  hypothetical protein  39.76 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.316617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4712  hypothetical protein  39.76 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4572  hypothetical protein  38.55 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0336291  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  35 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  38.67 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  35 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  37.33 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  33.75 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  37.84 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5374  Protein of unknown function DUF1778  33.73 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0668573  normal  0.988789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  42.5 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  27.91 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  38.46 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  28.92 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  31.78 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  26.97 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  31.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1985  hypothetical protein  36.11 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  34.29 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  41.27 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  29.07 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  33.77 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  34.25 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  31.08 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  38.1 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>