37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0956 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  245  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  50.57 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  49.38 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  46.75 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  54.05 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  43.59 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  46.34 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  43.59 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  47.44 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  42.05 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  41.89 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  43.06 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  43.06 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  36.14 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  48.48 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  36.47 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  39.51 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  35.58 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  39.47 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  39.47 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  39.47 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  39.47 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  36.71 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  35.53 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  32.63 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  28.92 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  28.92 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  31.65 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  35.53 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0280  hypothetical protein  39.51 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  32.91 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  32.89 
 
 		 112 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  28.75 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  31.25 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  32.14 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>