36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1372 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  38.61 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  38.38 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  41.38 
 
 
102 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  40.48 
 
 
101 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  39.51 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  38.46 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  38.96 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  38.96 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  38.96 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  38.96 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  40.79 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  32.95 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  32.95 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  32.95 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  34.65 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  34.18 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  28.4 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  38.3 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  32.94 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  27.27 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  39.51 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  25 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  28.4 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  32.56 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  29.11 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  34.67 
 
 
90 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  32.53 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  32.56 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  35.37 
 
 
113 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  34.25 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  36.59 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  35.82 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>