48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2581 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  55.29 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  63.16 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  52.87 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  52.87 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  52.94 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  50 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  52.63 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  48.35 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  57.95 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  51.35 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  48 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  43.9 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  43.59 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  39.24 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  45.59 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  45.95 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  31.87 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  39.08 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  41.46 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  36.78 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  31.87 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  35.29 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  40.24 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  40.24 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  32.94 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  31.17 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  31.17 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  38.81 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  32.94 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  37.8 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  31.58 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  32.05 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  35.9 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  32.47 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  32.47 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  32.47 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  32.47 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  36.49 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  40.24 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  32.47 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  32.91 
 
 		 95 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1355  hypothetical protein  32.88 
 
 		 113 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  30.99 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1171  CopG-like DNA-binding  32.05 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.693906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>