24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3304 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  60.47 
 
 
93 aa  104  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  52.87 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  50.57 
 
 
92 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  53.09 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  42.35 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  49.38 
 
 
114 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  51.28 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  43.06 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  38.75 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  47.3 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  35.14 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  40.58 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  35.37 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  35.9 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  37.04 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  35.14 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  32.53 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  39.02 
 
 
102 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  32.35 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  32.18 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  28.24 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>