39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3092 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  100 
 
 		 93 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  100 
 
 		 93 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  100 
 
 		 93 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  100 
 
 		 93 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  52.17 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  53.93 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  48.31 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  47.19 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  50 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  38.03 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  37.93 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  35.37 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  35.37 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  38.96 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  38.16 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  39.47 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  36.49 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  34.21 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  32.89 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  40.62 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  29.87 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  31.08 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  34.21 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  27.03 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  32.47 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  37.33 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  29.87 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  30.12 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  37.18 
 
 		 114 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  27.85 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  27.85 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  27.85 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  36.84 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  32.88 
 
 		 97 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  29.73 
 
 		 117 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>