41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2100 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 114 aa  230  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  88.99 
 
 		 116 aa  199  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  54.76 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  50 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  48.81 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  48.84 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  49.38 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  49.38 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  45.78 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  47.44 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  44.59 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  40.96 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  52.94 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  39.76 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  34.41 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  38.57 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  31.03 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  37.63 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  35.37 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  37.08 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  31.03 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  29.89 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  29.89 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  32.56 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  30.95 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  34.18 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  37.18 
 
 		 93 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  37.18 
 
 		 93 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  37.18 
 
 		 93 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  37.18 
 
 		 93 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  32.97 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  34.21 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  28.74 
 
 		 113 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  27.71 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  29.21 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  34.25 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  34.25 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>