32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4306 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 
92 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  65.17 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  52.81 
 
 
92 aa  93.6  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  56.18 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  50 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  50 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  50 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  50 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  49.44 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  42.11 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  33.73 
 
 
93 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  36.36 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  35.37 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  34.67 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  40.54 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  41.03 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  34.67 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  34.67 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  34.62 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  33.72 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  34.57 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  39.47 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  36.36 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 
114 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  35.9 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  34.67 
 
 
116 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  31.03 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  30.56 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>