35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1621 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 93 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  64.44 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  60.47 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  60.47 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  50.59 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  57.65 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  54.76 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  54.76 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  52.94 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  46.75 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  53.12 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  51.56 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  49.32 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  40.96 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  40.79 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  36.9 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  38.16 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  38.16 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  38.16 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  38.16 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  35.96 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  37.93 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  38.2 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  32.94 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  36.25 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  39.47 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  35.8 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  26.67 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  36.14 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  30.86 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  32.94 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  34.57 
 
 		 158 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  26.58 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  35.29 
 
 		 97 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>