50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10936 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  69.61 
 
 		 101 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  44.71 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0400  Protein of unknown function DUF1778  38.89 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00028613  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1171  CopG-like DNA-binding  46.15 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.693906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  43.53 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2169  hypothetical protein  42.57 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  41.18 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  43.75 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  37.63 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  38.46 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  39.53 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  41.1 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  37.35 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  37.35 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  32.94 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  37.35 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  37.35 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  37.35 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  36.14 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  39.74 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  37.14 
 
 		 90 aa  47.8  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  37.14 
 
 		 83 aa  47.8  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  29.9 
 
 		 100 aa  47.4  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  38.36 
 
 		 92 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  39.19 
 
 		 99 aa  47.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  38.81 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  36.9 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  35.62 
 
 		 92 aa  44.7  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  41.27 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  34.88 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  29.63 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  36.59 
 
 		 99 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  34.18 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  34.18 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  34.88 
 
 		 99 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  34.57 
 
 		 93 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3548  Protein of unknown function DUF1778  37.04 
 
 		 97 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214549  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  38.75 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  39.68 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  39.06 
 
 		 101 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3083  Protein of unknown function DUF1778  42.42 
 
 		 97 aa  42  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3430  Protein of unknown function DUF1778  40.79 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.410237  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  32 
 
 		 89 aa  41.6  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  36.62 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  36.84 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4572  hypothetical protein  35.63 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0336291  normal  0.326254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>