44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4869 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  72 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  54.17 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  49.38 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  48 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  45.78 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  45.78 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  48.24 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  51.56 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  36.84 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  38.1 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  38.38 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  44.3 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  45.83 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  41.86 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  39.02 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  39.02 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  39.02 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  46.38 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  33.73 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  40.58 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  40.58 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  33.73 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  37.5 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  37.5 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  37.5 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  37.5 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  32.94 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  37.35 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  36.14 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  35.44 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  32.98 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  35 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  37.5 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  36.99 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  27.85 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  32.5 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  31.33 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  34.15 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  31.65 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  35.94 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>