28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1843 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  69.23 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  53.93 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  53.93 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  53.93 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  53.93 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  50.56 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  52.81 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  39.19 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  37.93 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  32.91 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  32.91 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  38.75 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  35.53 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  37.84 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  29.07 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  32.98 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  32.14 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  31.65 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  31.65 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  31.65 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  32.47 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  30.67 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  32.43 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  32.47 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  34.15 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>