48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4538 on replicon NC_011723
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 
92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  40.96 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  39.51 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  37.78 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  35.8 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  34.94 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  33.73 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  37.78 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  35.37 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  32.91 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  29.07 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  34.12 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  34.12 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  34.12 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  31.87 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  40 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  33.73 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  31.03 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  32.94 
 
 
93 aa  50.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  28.74 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  31.17 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0915  hypothetical protein  36.67 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0663425  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0764  hypothetical protein  36.67 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  32.05 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  32.47 
 
 
92 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  28.4 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  29.35 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  28.4 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  30.49 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  26.25 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  26.97 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  25 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  27.85 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  31.82 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  26.09 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  27.03 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  27.03 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  27.03 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  27.03 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  26.97 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  29.76 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  23.66 
 
 
96 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2169  hypothetical protein  26.92 
 
 
135 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  25.29 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  34.92 
 
 
761 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>