48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1786 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  50.59 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  52.63 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  47.06 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  42.35 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  42.35 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  42.86 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  47.06 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  42.35 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  42.67 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  35.53 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  41.89 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  36.84 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  43.37 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  45.07 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  38.03 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  38.03 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  38.03 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  38.03 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  38.67 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  34.67 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  29.07 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  40.3 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  39.19 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  39.47 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  32.93 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  36.99 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  37.33 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  35.8 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  27.27 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  36.92 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  36.92 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  28.21 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  35.38 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  30.67 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  32.05 
 
 		 92 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  28.38 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  28.38 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  28.4 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  29.58 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  32 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  31.94 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  34.67 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>