33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0637 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  88.89 
 
 		 90 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0915  hypothetical protein  95.56 
 
 		 90 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0663425  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0764  hypothetical protein  95.56 
 
 		 90 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  70.33 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  45 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  45 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  45 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  43.68 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  37.78 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  41.18 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  36.11 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  36.99 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  36 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  32.1 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  32.1 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  36.14 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  33.33 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  33.33 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  33.33 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  32.5 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  38.16 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  34.67 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  28.4 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  32.91 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  36.9 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  36.11 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  37.65 
 
 		 92 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  30.56 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1985  hypothetical protein  32.5 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  35.44 
 
 		 96 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>