19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1985 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1985  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  224  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0723  hypothetical protein  39.56 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0144833  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0760  hypothetical protein  37.63 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3629  hypothetical protein  39.56 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0746  Protein of unknown function DUF1778  39.56 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0752  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  unclonable  0.0000108368 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4632  hypothetical protein  41.18 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0539  hypothetical protein, putative phage gene  41.67 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  34.04 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  35.44 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  36.11 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  32.47 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  34.72 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  30.12 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  31.75 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  31.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  34.41 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  32.5 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  30.95 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>