37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1730 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 93 aa  190  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  70.65 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  41.38 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  39.36 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  38.37 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  32.97 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  33.7 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  37.63 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  36.36 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  34.18 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  32.91 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0400  Protein of unknown function DUF1778  31.76 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00028613  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  35.29 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  34.21 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  34.21 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  37.88 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  27.16 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  29.33 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  34.21 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  29.11 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  29.11 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  27.96 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1985  hypothetical protein  34.41 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0502  hypothetical protein  29.63 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.145396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00382  hypothetical protein  29.63 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00876967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0462  hypothetical protein  29.63 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00378  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00680553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0467  hypothetical protein  29.63 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62565  normal  0.624691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  32.94 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  32.89 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1171  CopG-like DNA-binding  32.18 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.693906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>